MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W3201471820

Slow vaccination and immunity profile homogeny as a cause of SARS-CoV-2 antigenic drift

2021· article· en· W3201471820 sur OpenAlexaff
Nabeel Khan

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSARS-CoV-2 and COVID-19 Research
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésVaccinationImmunityImmunologyBiologyImmunizationImmune systemAntigenVirologyPopulationAntigenic driftHerd immunityMedicineEnvironmental health
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Delays in vaccine production for severe respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2), have resulted in countries dependent on foreign biomanufacturing capabilities to underperform in terms of their population immunization rates. The implications of slow vaccination and a comprehensive strategy to combat it have yet to be devised. Of particular concern is the exposure of SARS-CoV-2 to pressures created by vaccinated individuals which could promote antigenic drift negating vaccination efforts. Uncertainty also remains around the usage of the novel mRNA vaccines due to limited characterization of vaccinated host immunity profiles. If unable to induce lymphocytes of high diversity and longevity, mRNA vaccination could further accelerate the development of vaccine escape. This paper outlines the potential consequences of a slow vaccination with mRNA-based vaccines and recommends counteracting measures. It discusses (i) the mutable rate of key SARS-CoV-2 spike (S) protein sites that when altered, could lead to a loss of immunity; (ii) the potential of slow vaccination and mRNA vaccines causing antigenic drift; and (iii) methods of improving immunization rates through production-based means. Comparisons to previous pathogen cases suggest high risk of SARS-CoV-2 antigenic drift in response to slow vaccination and novel vaccines. These mutations are predicted to occur at several S protein epitopes. The results call for genomic surveillance initiatives to track development of immune evasion and longitudinal research of vaccinated host immunity profiles to measure durability and diversity of the induced humoral response. Recommendations for improving vaccination rate include the construction of production facilities and improvement of already existing distribution networks, while maintaining communication channels and transparency with the public.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,053
Tête enseignante GPT0,368
Écart entre enseignants0,315 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même sujetSARS-CoV-2 and COVID-19 Research→Travaux en français237 207→