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Enregistrement W3201877068 · doi:10.1101/2021.09.30.462584

Anisotropy of plasmalemmal sterols and cell mating require StARkin domain proteins Ysp2 and Lam4

2021· preprint· en· W3201877068 sur OpenAlexafffund
Neha Chauhan, Gregory D. Fairn

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueFungal and yeast genetics research
Établissements canadiensDalhousie UniversityUniversity of TorontoSt. Michael's Hospital
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaWeill Cornell Medical College
Mots-clésErgosterolPhosphatidylinositolCell biologyCytosolCell polarityPhosphatidylserineBiologyCDC42Fluorescence anisotropySaccharomyces cerevisiaeBiochemistryChemistryYeastCellKinaseMembranePhospholipid

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract In the budding yeast S. cerevisiae Cdc42 is required for polarized growth and the formation of mating projections (shmoos). Negatively charged lipids including phosphatidylserine and phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate support a positive feedback loop that recruits Cdc42 effectors and MAP kinase scaffolds, many of which contain polybasic patches that directly interact with the membrane. Here, using genetically encoded sterol sensor ALOD4 we find that ergosterol is accumulated in the cytosolic leaflet of buds and shmoos. The accumulation of ergosterol in the plasma membrane requires both Osh and Lam proteins however cells lacking Ysp2/Lam2 and Lam4 displayed a reversal in the polarity of ergosterol. The redistribution of ergosterol impairs the polarization of phosphatidylserine and phosphatidylinositol 4,5-bisphophate which further impacts shmoo formation, MAPK signaling and mating efficiency. Our observations demonstrate that the ability of Lam proteins to deliver ergosterol from the plasma membrane to the ER helps maintain a gradient of ergosterol which in turn supports robust cell polarity. Summary The sterol sensor ALOD4 is enriched at sites of polarized growth. Elimination of the Osh proteins solubilized the ALOD4 whereas elimination of Ysp2 and Lam4 reversed ALOD4 polarization. Cells lacking Ysp2 and Lam4 have defects in mating and MAP kinase signaling.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,219
Écart entre enseignants0,208 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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