Removal of large viruses and their dispersal through fecal pellets of the appendicularian<scp><i>Oikopleura dioica</i></scp>during<scp><i>Emiliania huxleyi</i></scp>bloom conditions
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Despite their importance in shaping the structure and function of marine microbial food webs, little is known about factors regulating marine virus abundance. Previous work demonstrated clearance of laboratory‐culturedEmiliania huxleyivirus by the appendicularianOikopleura dioica; however, the applicability of this interaction to natural virus assemblages was not investigated. Here, we conducted controlled laboratory experiments usingO. dioicaand mesocosm water containing natural virus assemblages with high densities of virus, and measured removal of virus byO. dioicausing both flow cytometry and molecular methods. Bayesian models based on flow cytometry quantification of virus particles demonstrated efficient removal of viruses (mean 90.3 mL ind−1d−1), with a clearance efficiency of 42.6% relative to food algae. Molecular detection of virus removal by quantification of viralmcpgene copies revealed a mean clearance rate of 68.1 mL ind−1d−1. Fecal pellets from these experiments demonstrated that viruses in fecal pellets retain infectivity despite passage through theO. dioicagut. Shotgun metavirome analysis demonstratedO. dioicaremoval of large virus groups, notably the Phycodnaviridae. The results demonstrate the removal ofE. huxleyivirus from natural virus assemblages byO. dioicaand the maintenance of viral infectivity when incorporated into fecal pellets, prompting further investigation on the fate of fecal‐packaged viruses and their impact on host dynamics. Furthermore, our results indicate the generality of this interaction for other large algal viruses, raising questions about the implications of this mechanism of marine virus redistribution on the broader marine virus community.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».