Schizophrenia Genetics and Neuropsychiatric Features in Childhood-onset Systemic Lupus Erythematosus
Notice bibliographique
Résumé
Objective We examined the association between schizophrenia genetic susceptibility loci and neuropsychiatric systemic lupus erythematosus (NPSLE) features in childhood-onset SLE (cSLE) participants. Methods Study participants from the Lupus Clinic at the Hospital for Sick Children, Toronto, met ≥ 4 of the American College of Rheumatology and/or SLE International Collaborating Clinics SLE classification criteria and were genotyped using the Illumina Multi-Ethnic Global Array or the Global Screening Array. Ungenotyped single-nucleotide polymorphisms (SNPs) were imputed, and ancestry was genetically inferred. We calculated 2 additive schizophrenia-weighted polygenic risk scores (PRS) using (1) genome-wide significant SNPs (P < 5 × 10–8), and (2) an expanded list of SNPs with significance at P < 0.05. We defined 2 outcomes compared to absence of NPSLE features: (1) any NPSLE feature, and (2) subtypes of NPSLE features (psychosis and nonpsychosis NPSLE). We completed logistic and multinomial regressions, first adjusted for inferred ancestry only and then added for variables significantly associated with NPSLE in our cohort (P < 0.05). Results We included 513 participants with cSLE. Median age at diagnosis was 13.8 years (IQR 11.2–15.6), 83% were female, and 31% were of European ancestry. An increasing schizophrenia genome-wide association PRS was not associated with NPSLE (OR 1.04, 95% CI 0.87–1.26, P = 0.62), nor with the NPSLE subtypes, psychosis (OR 0.97, 95% CI 0.73–1.29, P = 0.84) and other nonpsychosis NPSLE (OR 1.08, 95% CI 0.88–1.34, P = 0.45), in ancestry-adjusted models. Results were similar for the model including covariates (ancestry, malar rash, oral/nasal ulcers, arthritis, lymphopenia, Coombs-positive hemolytic anemia, lupus anticoagulant, and anticardiolipin antibodies) and for the expanded PRS estimates. Conclusion We did not observe an association between known risk loci for schizophrenia and NPSLE in a multiethnic cSLE cohort. This work warrants further validation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».