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Enregistrement W3202496295 · doi:10.26685/urncst.293

Fixing Pitx3 gene Mutation with CRISPR-Cas9 Intervention in Zygotic Aphakia-Prone Mice – A Research Protocol

2021· article· en· W3202496295 sur OpenAlexafffund
Hussam Sheikh, Hassan Alibhai, Gowsith Thilliaimbalam

Notice bibliographique

RevueUndergraduate Research in Natural and Clinical Science and Technology (URNCST) Journal · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNuclear Receptors and Signaling
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesUniversity of Toronto
Mots-clésCRISPRBiologyDopamine transporterGenome editingDopaminergicGeneticsDopamineGeneEndocrinology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Introduction: Despite the drawbacks of gene-editing, CRISPR-Cas9 remains a versatile tool for editing mutated genes. The mutated Pitx3 gene may cause aphakia in mice and Parkinsonism in humans. Pitx3 gene codes for the Pitx3 transcription factor involved in many tasks including the differentiation of dopaminergic neurons in the substantia nigra, tyrosine hydroxylase expression, dopamine transporter and lens development. We aim to edit mutated Pitx3 genes using CRISPR-Cas9 in embryonic-dopaminergic progenitor-neurons of mice and compare to wildtypes (WT) that do not undergo CRISPR-Cas9 intervention. Methods: We will use 5 female mice, 2 homozygous for mice aphakia/Pitx3 mutation (Ak) and 3 standard pseudo-pregnant females. 2-male homozygous (+/+ Ak) mice with Ak will mate with the aphakic females (+/+ Ak). Dopamine levels in both (aphakic/non-aphakic) mice will be determined. We will extract embryonic stem cells (ESC) from aphakic female’s uterus and treat with CRISPR-Cas9 and homology-directed repair (HDR). Both treated and untreated ESC will be divided between 3 pseudo-pregnant females. Post-parturition, intervention success will be assessed using presence of optical lens, dopamine levels and restriction sequence expression in treated/untreated progeny. Results: We expect to observe that untreated ESC zygotes (no CRISPR-Cas9 and HDR treatment) will not express normal Pitx3. This will result in low dopamine levels (inappropriate dopamine levels for their age group) and an aphakic mice progeny. Likewise, treated ESC zygotes will express normal Pitx3, hence have normal dopamine levels and non-aphakic phenotype. Discussion: Progeny of both groups (treated/non-treated) will be examined for aphakia, dopamine levels and restriction sequence. Dopamine levels of treated mice will be compared to dopamine levels of WT mice. Should none of the treated progeny develop lenses or have normal dopamine levels, these mice will be sacrificed to target the restriction sequence in the inserted gene — helping to evaluate why the inserted gene is unexpressed. Conclusion: This research examines CRISPR-Cas9 and HDR use on embryos with mutated genes that impair lens development and dopaminergic-neuron differentiation in humans and mice. It has potential of qualifying for clinical trials as the technique may be used to fix heritable disease-inducing genes that decrease longevity and quality of life in humans.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,013
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,006
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesÉtudes des sciences et des technologies, Intégrité de la recherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,505
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0130,006
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,006
Études des sciences et des technologies0,0010,004
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,004
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,121
Tête enseignante GPT0,473
Écart entre enseignants0,352 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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