MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W3202585972 · doi:10.21203/rs.3.rs-744517/v1

Effects of Glutamate and Aspartate on Prostate Cancer and Breast Cancer: A Mendelian Randomization Study

2021· preprint· en· W3202585972 sur OpenAlexfundno aff
Lihong Zhang, Yindan Lin, Ze Yang, Jingjia Li, Yandi Sun, Xueyun Zhang, Zihao Qu, Yan Luo

Notice bibliographique

RevueResearch Square · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMetabolomics and Mass Spectrometry Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institutes of HealthCancer Research UKGovernment of CanadaGenome Canada
Mots-clésMendelian randomizationBreast cancerProstate cancerMedicineOncologyCancerInternal medicineSingle-nucleotide polymorphismConfidence intervalGenome-wide association studyProstateGenotypeBiologyGeneticsGenetic variantsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background: Respectively, prostate cancer and breast cancer are the second most and most commonly diagnosed cancer in men and woman, and they account for major cancer-related deaths world-wide. Special attention aiming to find potentially effective early detection of, and intervention strategies against, prostate cancer (PCa) and breast cancer need to be paid.Objective: Utilizing Mendelian randomization (MR), we aimed to estimate how genetically predicted glutamate and aspartate levels affected prostate and breast cancers development. Methods: Single nucleotide polymorphisms (SNPs) were selected as instrumental variables (IVs) to predict the serum levels of glutamate and aspartate from the publicly available genome-wide association studies (GWASs), which were conducted to associate genetic variations with blood metabolite levels using comprehensive metabolite profiling in 1,960 adults and the glutamate and aspartate we chosen were two of 644 metabolites. The summary statistics for the largest and latest GWAS datasets for prostate cancer (61,106 controls and 79,148 cases) were from the Prostate Cancer Association Group to Investigate Cancer Associated Alterations in the Genome (PRACTICAL) consortium and datasets for breast cancer (113,789 controls and 133,384 cases) were from Breast Cancer Association Consortium (BCAC). The analyses were performed through two-sample MR method. Results: Serum level of aspartate was positively associated with prostate cancer (Effect = 1.043; 95% confidence interval, 1.003 to 1.084; P = 0.034) and breast cancer (Effect = 1.033; 95% confidence interval, 1.004 to 1.063; P = 0.028); however, glutamate was neither associated with prostate cancer and breast cancer. The potential causal associations were robust to the sensitivity analysis.Conclusions: Our study found that the level of serum aspartate could serve as a risk factor that contributed to the development of prostate and breast cancers. Efforts detailing the underlying mechanism(s) would be extremely valuable in early assessment/diagnosis and strategizing clinical intervention of both cancers.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,013
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,023
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,013
Score d'incertitude au seuil0,066

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0130,023
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,003
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,354
Écart entre enseignants0,338 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueResearch Square→Même sujetMetabolomics and Mass Spectrometry Studies→Travaux en français237 207→