MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W3202631206 · doi:10.1038/s41586-021-03893-6

Author Correction: Transcriptional programs of neoantigen-specific TIL in anti-PD-1-treated lung cancers

2021· erratum· en· W3202631206 sur OpenAlexaff
Justina X. Caushi, Jiajia Zhang, Zhicheng Ji, Ajay Vaghasia, Boyang Zhang, Emily Han-Chung Hsiue, Brian J. Mog, Wenpin Hou, Sune Justesen, Richard L. Blosser, Ada Tam, Valsamo Anagnostou, Tricia R. Cottrell, Haidan Guo, Hok Yee Chan, Dipika Singh, Sampriti Thapa, Arbor G. Dykema, Poromendro Burman, Begum Choudhury, Luis Aparicio, Laurene S. Cheung, Mara Lanis, Zineb Belcaid, Margueritta El Asmar, Peter B. Illei, Rulin Wang, Jennifer Meyers, Kornel Schuebel, Anuj Gupta, Alyza Skaist, Sarah J. Wheelan, Jarushka Naidoo, Kristen A. Marrone, Malcolm V. Brock, Jinny S. Ha, Errol L. Bush, Bernard J. Park, Matthew J. Bott, David R. Jones, Joshua E. Reuss, Victor E. Velculescu, Jamie E. Chaft, Kenneth W. Kinzler, Shibin Zhou, Bert Vogelstein, Janis M. Taube, Matthew D. Hellmann, Julie R. Brahmer, Taha Merghoub, Patrick M. Forde, Srinivasan Yegnasubramanian, Hongkai Ji, Drew M. Pardoll, Kellie N. Smith

Notice bibliographique

RevueNature · 2021
Typeerratum
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCancer Immunotherapy and Biomarkers
Établissements canadiensQueen's UniversityOntario Institute for Cancer Research
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical SciencesNational Human Genome Research Institute
Mots-clésLungMedicineCancer researchBiologyComputational biologyInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In the originally published version of this Article there were three labeling errors in Fig. 1. The cluster names for “CD8-MHCII” and “CD8-proliferating” were switched and the cluster names for “Stem-like memory” and “MAIT” were switched (Fig. 1c). Their positions have now been corrected. In Fig. 1d, a typo in the “ SCL4A10 ” gene label has been corrected to “ SLC4A10 .” The legend for Fig. 1c originally referred to the heatmap as displaying the “top-5” most differential genes. This has been corrected to “the top-3” most differential genes. In the eighth paragraph of main text, a typo in the gene name “ LINC02246 ” has been corrected to “ LINC02446 .” Further, in Supplementary Table 9, the data point “5” was missing in the Number of nonsynonymous mutations per exome column for patient NY016-007; this has now been corrected. The original Article has been corrected online.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,033
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Autre · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,040
Score d'incertitude au seuil0,135

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,033
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0020,002
Communication savante0,0030,002
Science ouverte0,0030,001
Intégrité de la recherche0,0060,009
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0400,020

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,290
Écart entre enseignants0,273 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreAutre

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentnon

Explorer davantage

Même revueNature→Même sujetCancer Immunotherapy and Biomarkers→Travaux en français237 207→