Distribution and Molecular Diversity of Whitefly Species Colonizing Cassava in Kenya
Notice bibliographique
Résumé
The whitefly, Bemisia tabaci (Gennadium, Hemiptera) has been reported to transmit viruses that cause cassava mosaic disease (CMD) and cassava brown streak disease (CBSD) in many parts of sub-Saharan Africa (SSA). Currently, there is limited information on the distribution, species and haplotype composition of the whitefly populations colonizing cassava in Kenya. A study was conducted in the major cassava growing regions of Kenya to address this gap. Analyses of mitochondrial DNA cytochrome oxidase 1 (mtCO1) sequences revealed the presence of four distinct whitefly species: Bemisia tabaci, Bemisia afer, Aleurodicus dispersus and Paraleyrodes bondari in Kenya. The B. tabaci haplotypes were further resolved into SSA1, SSA2 and Indian Ocean (IO) putative species. The SSA1 population had three haplogroups of SSA1-SG1, SSA-SG2 and SSA1-SG3. Application of KASP genotyping grouped the Bemisia tabaci into two haplogroups namely sub-Saharan Africa East and Southern Africa (SSA-ESA) and sub-Saharan Africa East and Central Africa (SSA-ECA). The study presents the first report of P. bondari (Bondar’s nesting whitefly) on cassava in Kenya. Bemisia tabaci was widely distributed in all the major cassava growing regions in Kenya. The increased detection of different whitefly species on cassava and genetically diverse B. tabaci mitotypes indicates a significant influence on the dynamics of cassava virus epidemics in the field. The study highlights the need for continuous monitoring of invasive whitefly species population on cassava for timely application of management practices to reduce the impact of cassava viral diseases and prevent potential yield losses.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».