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Enregistrement W3203197823 · doi:10.1002/cpz1.263

Visualization of the Skeletal Muscle Stem Cell Niche in Fiber Bundles

2021· article· en· W3203197823 sur OpenAlexafffund
Svenja C. Schüler, Simon Dumontier, Jonathan Rigaux, C. Florian Bentzinger

Notice bibliographique

RevueCurrent Protocols · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMuscle Physiology and Disorders
Établissements canadiensCentre Hospitalier Universitaire de SherbrookeUniversité de Sherbrooke
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésSkeletal muscleCell biologyExtracellular matrixBiologyStem cellMesenchymal stem cellBasal laminaPathologyAnatomyUltrastructureMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Skeletal muscle stem cells (MuSCs) reside in a complex niche composed of the muscle fiber plasma membrane and the laminin-rich basal lamina surrounded by the microvasculature, as well as different supportive cell types such as fibro-adipogenic progenitors residing in the interstitial extracellular matrix. Within the first few hours after tissue damage, MuSCs undergo cytoskeletal rearrangements and transcriptional changes that prime the cells for activation. Due to their time-consuming nature, enzymatic methods for liberation of single muscle fibers with fully quiescent MuSCs are challenging. Moreover, during enzymatic digestion, important niche components including the microvasculature and the collagenous interstitial matrix are destroyed. Here, we provide a method for the visualization of MuSCs on muscle fibers in their intact niche. Our method relies on mechanical teasing of fiber bundles from fixed skeletal muscles. We demonstrate that teased muscle fiber bundles allow the investigator to capture a representative snapshot of the MuSC niche in skeletal muscle, and outline how stem cell morphology and different microenvironmental components can be visualized. © 2021 The Authors. Current Protocols published by Wiley Periodicals LLC. Basic Protocol 1: Isolation of fiber bundles Basic Protocol 2: Immunofluorescence staining of MuSCs on fiber bundles Support Protocol: Preparation of Sylgard dishes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,018

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,324
Écart entre enseignants0,300 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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