MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3203228154 · doi:10.1111/joim.13386

Low anti‐SARS‐CoV‐2 S antibody levels predict increased mortality and dissemination of viral components in the blood of critical COVID‐19 patients

2021· article· en· W3203228154 sur OpenAlexafffund
María Martin‐Vicente, Raquel Almansa, Isidoro Martínez, Ana P. Tedim, Elena Bustamante, Luís Tamayo, César Aldecoa, Gloria Renedo, José Ángel Berezo, Jamil Cedeño, Nuria Mamolar, Pablo García Olivares, Rubén Herrán‐Monge, Ramón Cicuéndez, Pedro Enríquez, Alicia Ortega, Noelia Jorge, Cristina Doncel, Amanda de la Fuente, Juan Bustamante‐Munguira, María José Muñoz‐Gómez, Milagros González‐Rivera, Carolina Puertas, Vicente Más, Mónica Vázquez, Felipe Pérez‐García, Jesús Rico-Feijoó, Silvia Martín, Ana Motos, Laia Fernández‐Barat, José María Eirós Bouza, Marta Domínguez‐Gil, Ricard Ferrer, Ferrán Barbé, Wysali Trapiello, David J. Kelvin, Jesús F. Bermejo-Martín, Salvador Resino, Antoní Torres

Notice bibliographique

RevueJournal of Internal Medicine · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSARS-CoV-2 and COVID-19 Research
Établissements canadiensDalhousie University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchResearch Nova ScotiaInstituto de Salud Carlos IIIGenome CanadaDalhousie Medical Research Foundation
Mots-clésAntibodyMedicineViral loadSevere acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)ImmunologyVirologyCoronavirus disease 2019 (COVID-19)Viral diseaseVirusInternal medicineDiseaseInfectious disease (medical specialty)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Anti-SARS-CoV-2 S antibodies prevent viral replication. Critically ill COVID-19 patients show viral material in plasma, associated with a dysregulated host response. If these antibodies influence survival and viral dissemination in ICU-COVID patients is unknown. PATIENTS/METHODS: We studied the impact of anti-SARS-CoV-2 S antibodies levels on survival, viral RNA-load in plasma, and N-antigenaemia in 92 COVID-19 patients over ICU admission. RESULTS: Frequency of N-antigenaemia was >2.5-fold higher in absence of antibodies. Antibodies correlated inversely with viral RNA-load in plasma, representing a protective factor against mortality (adjusted HR [CI 95%], p): (S IgM [AUC ≥ 60]: 0.44 [0.22; 0.88], 0.020); (S IgG [AUC ≥ 237]: 0.31 [0.16; 0.61], <0.001). Viral RNA-load in plasma and N-antigenaemia predicted increased mortality: (N1-viral load [≥2.156 copies/ml]: 2.25 [1.16; 4.36], 0.016); (N-antigenaemia: 2.45 [1.27; 4.69], 0.007). CONCLUSIONS: Low anti-SARS-CoV-2 S antibody levels predict mortality in critical COVID-19. Our findings support that these antibodies contribute to prevent systemic dissemination of SARS-CoV-2.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,066
Tête enseignante GPT0,431
Écart entre enseignants0,366 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations65
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Internal MedicineMême sujetSARS-CoV-2 and COVID-19 ResearchTravaux en français237 207