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Enregistrement W3203305636 · doi:10.1021/acs.iecr.1c00634

Toward Predictive Chemical Deformulation Enabled by Deep Generative Neural Networks

2021· article· en· W3203305636 sur OpenAlexaff
Emre Sevgen, Edward Kim, Brendan Folie, Ventura Rivera, Jason Koeller, Emily Rosenthal, Andrea Jacobs, Julia Ling

Notice bibliographique

RevueIndustrial & Engineering Chemistry Research · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueComputational Drug Discovery Methods
Établissements canadiensXerox (Canada)
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAutoencoderComputer scienceLeverage (statistics)Artificial neural networkArtificial intelligenceGenerative grammarIngredientMachine learningChemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The design of chemical formulations is a challenging, high-dimensional problem. In typical formulations, tens of thousands of ingredients are available for use, yet only a tiny fraction end up in a given formulation. Deformulation, the problem of reverse engineering the precise amounts of each ingredient starting from just a list of ingredients, is similarly challenging but is a key capability for staying up-to-date with industry competitors. Here, we take advantage of a large, curated formulations dataset from CAS, a division of the American Chemical Society, which offers a consistent and highly structured representation of the formulations and the chemical identities of their components to show that a variational autoencoder neural network learns meaningful representations of formulations in various product classes such as antiperspirants and oral care. Furthermore, it can be used in conjunction with a two-step sampling algorithm to generate accurate ingredient amount suggestions for deformulation. Deformulation using a variational autoencoder produces estimates that are significantly more accurate than nearest neighbor methods, extrapolates better to formulations that are significantly different than previously seen formulations, and provides a way to leverage large datasets for industrially relevant capabilities.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,011
Score d'incertitude au seuil0,021

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,084
Tête enseignante GPT0,337
Écart entre enseignants0,254 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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