Toward understanding of the methoxylated flavonoid biosynthesis pathway in Dracocephalum kotschyi Boiss
Notice bibliographique
Résumé
Nowadays, with the development and advancement of next-generation sequencing technologies, a new path has been provided for transcriptomic studies. In this study, the transcriptome of Dracocephalum kotschyi Boiss., as an endemic and endangered plant which is contained a large amount of valuable secondary metabolites with antioxidant and anticancer properties, was sequenced. Then functional annotation and gene ontology analysis for 165,597 assembled transcripts were performed, most were associated with the metabolic pathways. This might be because there are various active biochemical pathways in this plant. Furthermore, after comprehensive transcript annotation, the putative genes involved in the main metabolic pathways of D. kotschyi were identified. Then, the biosynthetic pathway of its valuable methoxylated flavones was proposed. Finally, the accumulations of important methoxylated-flavone metabolites in three different tissues were quantified by HPLC. The relative expression of the genes involved in the proposed pathway was investigated by qRT-PCR, which indicated high expression levels in the bud tissue. The present results may lead to the design strategies to preserve the genetic diversity of endangered D. kotschyi plants and apply the new methods for engineering its valuable methoxylated-flavones pathway.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».