RNA helicase DDX6 in P-bodies is essential for the assembly of stress granules
Notice bibliographique
Résumé
Summary Two prominent cytoplasmic RNA granules, ubiquitous RNA-processing bodies (PB) and inducible stress granules (SG), regulate storage of translationally arrested mRNAs and are intimately related. In this study, we found the dependence of SG formation on PB in the cells under arsenite (ARS) stress, but not the other way around. GW182, 4E-T and DDX6 essential for PB formation differentially affect SG formation in the cells under ARS stress, with DDX6 being the most prominent. The cells with DDX6 deficiency display irregular shape of SG which could be rescued by ectopic wt DDX6, but not its helicase mutant E247A DDX6, which induces SG in the cells without stress, indicating that DDX6 helicase activity is essential for PB, but suppressive for SG. DDX6’s dual roles are independent of DDX6 interactors EDC3, CNOT1, and PAT1B. This study provides a conceptual advance of how DDX6 involves in the biogenesis of PB and SG. Highlights PB act as the seeds for SG nucleation PB components colocalize with SG DDX6 plays a critical role in biogenesis of both PB and SG DDX6 helicase activity prevents SG formation in normal cells
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».