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Enregistrement W3203609958 · doi:10.3389/fcell.2021.727972

Polycomb Requires Chaperonin Containing TCP-1 Subunit 7 for Maintaining Gene Silencing in Drosophila

2021· article· en· W3203609958 sur OpenAlexfundno aff
Najma Shaheen, Jawad Akhtar, Zain Umer, Muhammad Haider Farooq Khan, Mahnoor Hussain Bakhtiari, Murtaza Saleem, Amir Faisal, Muhammad Tariq

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Cell and Developmental Biology · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEpigenetics and DNA Methylation
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesInstitute of GeneticsHigher Education Commision, PakistanHigher Education Commission, PakistanLahore University of Management Sciences
Mots-clésChromatinBiologyPolycomb-group proteinsHomeotic geneEpigeneticsGeneticsPsychological repressionChaperoninHistoneCell biologyGene silencingChromodomainGeneMutantTranscription factorGene expressionRepressorRNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In metazoans, heritable states of cell type-specific gene expression patterns linked with specialization of various cell types constitute transcriptional cellular memory. Evolutionarily conserved Polycomb group (PcG) and trithorax group (trxG) proteins contribute to the transcriptional cellular memory by maintaining heritable patterns of repressed and active expression states, respectively. Although chromatin structure and modifications appear to play a fundamental role in maintenance of repression by PcG, the precise targeting mechanism and the specificity factors that bind PcG complexes to defined regions in chromosomes remain elusive. Here, we report a serendipitous discovery that uncovers an interplay between Polycomb (Pc) and chaperonin containing T-complex protein 1 (TCP-1) subunit 7 (CCT7) of TCP-1 ring complex (TRiC) chaperonin in Drosophila. CCT7 interacts with Pc at chromatin to maintain repressed states of homeotic and non-homeotic targets of PcG, which supports a strong genetic interaction observed between Pc and CCT7 mutants. Depletion of CCT7 results in dissociation of Pc from chromatin and redistribution of an abundant amount of Pc in cytoplasm. We propose that CCT7 is an important modulator of Pc, which helps Pc recruitment at chromatin, and compromising CCT7 can directly influence an evolutionary conserved epigenetic network that supervises the appropriate cellular identities during development and homeostasis of an organism.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,244
Écart entre enseignants0,230 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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