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Enregistrement W3203759264 · doi:10.26685/urncst.291

Recombinant Antimicrobial Peptide Fusion Between Crotalicidin Fragment Tag and Bacteriophage Endolysin T5 as a Potential Antibacterial Agent Against Multidrug Resistant Gram-Negative Bacteria: A Research Protocol

2021· article· en· W3203759264 sur OpenAlexafffund
Alex Huynh, Dalraj Dhillon, Dhairya Bhatt, Eric Zhang

Notice bibliographique

RevueUndergraduate Research in Natural and Clinical Science and Technology (URNCST) Journal · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueBacteriophages and microbial interactions
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesMcMaster University
Mots-clésLysinMicrobiologyPseudomonas aeruginosaBiologyRecombinant DNAMultiple drug resistanceGram-negative bacteriaAntimicrobialAntimicrobial peptidesBacteriaPeptidoglycanBacteriophageEscherichia coliAntibioticsBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Introduction: Endolysins, antimicrobial peptides that disrupt the peptidoglycan (PG) layer of bacteria, are a strong alternative to common antibiotics and less prone to antibiotic resistance. However, endolysins are ineffective against gram-negative bacteria due to an additional outer membrane (OM) blocking the PG layer. This research protocol aims to address this caveat by developing a novel recombinant endolysin peptide, EndoT5-Ctn (15-34), comprised of phage Endolysin T5 and a Crotalicidin tag (Ctn (15-34)) capable of permeabilizing the OM. This would render the endolysin effective against gram-negative bacteria such as multidrug-resistant (MDR) Pseudomonas aeruginosa. Methods: Experimentation will begin with recombinant DNA techniques to engineer a bacterial vector which expresses the EndoT5-Ctn (15-34) peptide. Protein expression will be achieved in competent BL21 (DE3) E. coli strains before protein isolation with lysis methods and immobilized-metal affinity chromatography. Resulting sample concentrations will be assayed using spectrophotometry. Finally, in vivo minimal inhibitory and bactericidal concentration assays will be conducted on MDR P. aeruginosa and methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) to evaluate bactericidal efficacy. Results: A minimal bactericidal concentration of EndoT5-Ctn (15-34) recombinant endolysin is expected to yield significant bactericidal activity against the MDR P. aeruginosa strain with limited effect on the gram-positive MRSA. A higher concentration of recombinant endolysin is expected to maintain its gram-negative bactericidal efficacy with an imported gram�positive bactericidal efficacy. Discussion: The observed bactericidal efficacy on AMR and non-AMR strains on P. aeruginosa will prompt further exploration of the therapeutic feasibility of this therapy regarding factors such as cytotoxicity, immunogenicity, and thermal stability. The potential introduction of recombinant endolysins presents an alternative treatment for infections with reduced risk of inducing resistant mutations. Conclusion: The EndoT5-Ctn (15-34) recombinant endolysin is a novel anti-bacterial agent which is expected to have significant bactericidal effects on MDR strains of gram-negative bacteria which current antibiotics have been ineffective at combating.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Protocole · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,042
Tête enseignante GPT0,394
Écart entre enseignants0,352 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreProtocole

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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