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Enregistrement W3204024700 · doi:10.7554/elife.67397

HIV status alters disease severity and immune cell responses in Beta variant SARS-CoV-2 infection wave

2021· article· en· W3204024700 sur OpenAlexaff
Farina Karim, Inbal Gazy, Sandile Cele, Yenzekile Zungu, Robert Krause, Mallory Bernstein, Khadija Khan, Yashica Ganga, Hylton Rodel, Ntombifuthi Mthabela, Matilda Mazibuko, Daniel Muema, Dirhona Ramjit, Thumbi Ndung’u, Willem A. Hanekom, Bernadett I. Gosnell, Moherndran Archary, Kaylesh J Dullabh, Jennifer Giandhari, Philip Goulder, Guy Harling, Rohen Harrichandparsad, Kobus Herbst, Prakash Jeena, Thandeka Khoza, Nigel Klein, Rajhmun Madansein, Mohlopheni J. Marakalala, Mosa Moshabela, Zaza M. Ndhlovu, Kennedy Nyamande, Nesri Padayatchi, Vinod Patel, Theresa Smit, Adrie J. C. Steyn, Richard Lessells, Emily Wong, Túlio de Oliveira, Mahomed-Yunus S. Moosa, Gil Lustig, Alasdair Leslie, Henrik N. Kløverpris, Alex Sigal

Notice bibliographique

RevueeLife · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSARS-CoV-2 and COVID-19 Research
Établissements canadiensInstitute of Infection and Immunity
Organismes subventionnairesBill and Melinda Gates Foundation
Mots-clésImmune systemVirologyBETA (programming language)Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)DiseaseImmunologyCoronavirus disease 2019 (COVID-19)Human immunodeficiency virus (HIV)BiologyMedicine2019-20 coronavirus outbreakInfectious disease (medical specialty)Internal medicineOutbreak

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

There are conflicting reports on the effects of HIV on COVID-19. Here, we analyzed disease severity and immune cell changes during and after SARS-CoV-2 infection in 236 participants from South Africa, of which 39% were people living with HIV (PLWH), during the first and second (Beta dominated) infection waves. The second wave had more PLWH requiring supplemental oxygen relative to HIV-negative participants. Higher disease severity was associated with low CD4 T cell counts and higher neutrophil to lymphocyte ratios (NLR). Yet, CD4 counts recovered and NLR stabilized after SARS-CoV-2 clearance in wave 2 infected PLWH, arguing for an interaction between SARS-CoV-2 and HIV infection leading to low CD4 and high NLR. The first infection wave, where severity in HIV negative and PLWH was similar, still showed some HIV modulation of SARS-CoV-2 immune responses. Therefore, HIV infection can synergize with the SARS-CoV-2 variant to change COVID-19 outcomes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,121
Score d'incertitude au seuil0,628

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,041
Tête enseignante GPT0,334
Écart entre enseignants0,293 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations49
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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