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Enregistrement W3204417766 · doi:10.1016/j.xcrm.2021.100421

Determinants of SARS-CoV-2 entry and replication in airway mucosal tissue and susceptibility in smokers

2021· article· en· W3204417766 sur OpenAlexfundno aff
Tsuguhisa Nakayama, Ivan T. Lee, Sizun Jiang, Matthias S. Matter, Carol H. Yan, Jonathan B. Overdevest, Chien-Ting Wu, Yury Goltsev, Liang‐Chun Shih, Chun‐Kang Liao, Bokai Zhu, Yunhao Bai, Peter V. Lidsky, Yinghong Xiao, David Zarabanda, Angela Yang, Meena Easwaran, Christian M. Schürch, Pauline Chu, Han Chen, Anna K. Stalder, David R. McIlwain, Nicole A. Borchard, Phillip A. Gall, Sachi S. Dholakia, Wei Le, Le Xu, Chih‐Jaan Tai, Te‐Huei Yeh, Elizabeth Erickson, Jason M. Duran, Kirsten D. Mertz, Peter H. Hwang, Jasmin D. Haslbauer, Peter K. Jackson, Thomas Menter, Raul Andino, Peter Canoll, Adam S. DeConde, Zara M. Patel, Alexandar Tzankov, Garry P. Nolan, Jayakar V. Nayak

Notice bibliographique

RevueCell Reports Medicine · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSARS-CoV-2 and COVID-19 Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesStanford Maternal and Child Health Research InstituteNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNational Cancer InstituteNational Heart, Lung, and Blood InstituteAdvanced Research Projects AgencyDefense Advanced Research Projects AgencyU.S. Food and Drug AdministrationParker Institute for Cancer ImmunotherapyNational Institutes of HealthSchweizerischer Nationalfonds zur Förderung der Wissenschaftlichen ForschungThrasher Research FundLeukemia and Lymphoma SocietyRocheCalifornia Institute for Regenerative MedicineDefence Science and Technology LaboratoryHamilton Health Sciences FoundationBill and Melinda Gates FoundationNational Science Foundation
Mots-clésTropismRespiratory tractViral replicationVirologyCoronavirusImmunologyBiologyTissue tropismInterferonAirwayLungRespiratory systemVirusMedicineDiseaseCoronavirus disease 2019 (COVID-19)PathologyInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Understanding viral tropism is an essential step toward reducing severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) transmission, decreasing mortality from coronavirus disease 2019 (COVID-19) and limiting opportunities for mutant strains to arise. Currently, little is known about the extent to which distinct tissue sites in the human head and neck region and proximal respiratory tract selectively permit SARS-CoV-2 infection and replication. In this translational study, we discover key variabilities in expression of angiotensin-converting enzyme 2 (ACE2) and transmembrane serine protease 2 (TMPRSS2), essential SARS-CoV-2 entry factors, among the mucosal tissues of the human proximal airways. We show that SARS-CoV-2 infection is present in all examined head and neck tissues, with a notable tropism for the nasal cavity and tracheal mucosa. Finally, we uncover an association between smoking and higher SARS-CoV-2 viral infection in the human proximal airway, which may explain the increased susceptibility of smokers to developing severe COVID-19. This is at least partially explained by differences in interferon (IFN)-β1 levels between smokers and non-smokers.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,041
Tête enseignante GPT0,371
Écart entre enseignants0,330 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations28
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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