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Enregistrement W3204711070 · doi:10.1080/07060661.2021.1936649

Understanding the expression and interaction of <i>Rph</i> genes conferring seedling and adult plant resistance to <i>Puccinia hordei</i> in barley

2021· article· en· W3204711070 sur OpenAlexvenueno aff
Lovepreet Singh, Robert Park, Peter M. Dracatos, Laura Ziems, Davinder Singh

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Plant Pathology · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueWheat and Barley Genetics and Pathology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSeedlingBiologyInoculationGeneRust (programming language)HorticultureBotanyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Leaf rust caused by Puccinia hordei is a major disease of barley and is best managed by deploying effective resistance genes. The effect of post-inoculation temperature [18 ± 2°C (low), 22 ± 2°C (mid), or 26 ± 2°C (high)] on the expression of a selection of known all stage resistance (ASR) Rph genes and their interaction in combination with the adult plant resistance (APR) gene Rph20 were investigated in barley. Rph1.a and Rph2.b expressed best at higher temperatures whereas Rph4.d lost its effectiveness at higher temperatures when tested with pathotype (pt) 200 P− (avirulent on these genes). The expression of the genes Rph3.c, Rph5.e, Rph6.f, Rph12 (9.z), Rph13.x and Rph15.ad was not affected by post-inoculation temperature. The interaction between Rph14.ab and pt 5457 P+ gave the lowest infection type at low post-inoculation temperature. Among a selection of lines carrying Rph20 (‘Flagship’), Rph23 (‘Yerong’) and Rph24 (‘ND24260ʹ), higher levels of resistance were observed in seedlings of ‘Flagship’ (Rph20) at lower temperatures, while seedlings of ‘Yerong’ (Rph23) and ‘ND24260ʹ (Rph24) showed high infection types at all three temperatures with pt 5457 P+. When RphASR genes were combined with the APR gene Rph20 an enhanced level of seedling resistance was observed in the six combinations: Rph1.a+Rph20, Rph2.b+Rph20, Rph4.d+Rph20, Rph9.i+Rph20, Rph5.e+Rph20 and Rph15.ad+Rph20. Seedlings carrying the Rph5.e+Rph20 combination remained resistant when challenged with the Rph5.e-virulent pt 220 P+ + Rph13, suggesting a residual effect of Rph5.e when present in combination with Rph20. This is the first study to demonstrate that several ASR Rph genes interact with the APR gene Rph20 in an additive manner, emphasizing the importance of deploying genes in combination rather than individually to achieve durable resistance.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,040
Tête enseignante GPT0,212
Écart entre enseignants0,172 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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