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Enregistrement W3204808009 · doi:10.1101/2021.09.25.21264097

Age-Specific Changes in Virulence Associated with SARS-CoV-2 Variants of Concern

2021· preprint· en· W3204808009 sur OpenAlexafffundabout
David N. Fisman, Ashleigh R. Tuite

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSARS-CoV-2 and COVID-19 Research
Établissements canadiensPublic Health Agency of CanadaPublic Health OntarioUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesSanofiPublic Health AgencyPublic Health Agency of CanadaSeqirusAstraZenecaPfizer
Mots-clésMedicineOdds ratioIntensive care unitConfidence intervalLogistic regressionVaccinationOutbreakRetrospective cohort studyVirulenceCohort studyResidenceDemographyInternal medicineImmunologyBiologyVirology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Novel variants of concern (VOCs) have been associated with both increased infectivity and virulence of SARS-CoV-2. The virulence of SARS-CoV-2 is closely linked to age. Whether relative increases in virulence of novel VOCs is similar across the age spectrum, or is limited to some age groups, is unknown. Methods We created a retrospective cohort of people in Ontario, Canada testing positive for SARS-CoV-2 and screened for VOCs, with dates of test report between February 7 and August 30, 2021 (n=233,799). Cases were classified as N501Y-positive VOC, probable Delta VOC, or VOC undetected. We constructed age-specific logistic regression models to evaluate the effects of N501Y-postive or Delta VOC infections on infection severity, using hospitalization, intensive care unit (ICU) admission, and death as outcome variables. Models were adjusted for sex, time, health unit, vaccination status, comorbidities, immune compromise, long-term care residence, healthcare worker status, and pregnancy. Results Infection with either N501Y-positive or Delta VOCs was associated with significant elevations in risk of hospitalization, ICU admission, and death in younger and older adults, compared to infections where a VOC was not detected. Delta VOC increased hospitalization risk in children under 10 by a factor of 2.5 (adjusted odds ratio, 95% confidence interval: 1.2 to 5.1) compared to non-VOC. For most VOC-outcome combinations there was no heterogeneity in adverse outcomes by age. However, there was an inverse relationship between age and relative increase in risk of death with delta VOC, with younger age groups showing a greater relative increase in risk of death than older individuals. Interpretation SARS-CoV-2 VOCs appear to be associated with increased relative virulence of infection in all age groups, though low absolute numbers of outcomes in younger individuals make estimates in these groups imprecise.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,113
Tête enseignante GPT0,357
Écart entre enseignants0,243 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2021
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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