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Enregistrement W3204948040 · doi:10.1016/j.jcmgh.2021.09.017

Rab9 Mediates Pancreatic Autophagy Switch From Canonical to Noncanonical, Aggravating Experimental Pancreatitis

2021· article· en· W3204948040 sur OpenAlexaff
Olga A. Mareninova, Dustin L. Dillon, Carli J. Wightman, Iskandar Yakubov, Toshimasa Takahashi, Herbert Y. Gaisano, Keith Munson, Masaki Ohmuraya, David W. Dawson, Ilya Gukovsky, Anna S. Gukovskaya

Notice bibliographique

RevueCellular and Molecular Gastroenterology and Hepatology · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAutophagy in Disease and Therapy
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesNational Cancer InstituteNational Institute on Alcohol Abuse and AlcoholismNational Institutes of HealthU.S. Department of Veterans Affairs
Mots-clésAutophagyATG5Cell biologyAutophagosomePancreatitisBiologyInternal medicineMedicineApoptosisBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Autophagy is essential for pancreas homeostasis.Autophagosome, key organelle in this process, forms via canonical or noncanonical pathways.We show that the small GTPase Rab9 inhibits canonical and promotes noncanonical autophagy in pancreas; Rab9 overexpression causes organ damage and worsens pancreatitis.BACKGROUND: Autophagosome, the central organelle in autophagy process, can assemble via canonical pathway mediated by LC3-II, the lipidated form of autophagy-related protein LC3/ATG8, or noncanonical pathway mediated by the small GTPase Rab9.Canonical autophagy is essential for exocrine pancreas homeostasis, and its disordering initiates and drives pancreatitis.The involvement of noncanonical autophagy has not been explored.We examine the role of Rab9 in pancreatic autophagy and pancreatitis severity. METHODS:We measured the effect of Rab9 on parameters of autophagy and pancreatitis responses using transgenic mice overexpressing Rab9 (Rab9 TG ) and adenoviral transduction of acinar cells.Effect of canonical autophagy on Rab9 was assessed in ATG5-deficient acinar cells.RESULTS: Pancreatic levels of Rab9 and its membrane-bound (active) form decreased in rodent pancreatitis models and in human disease.Rab9 overexpression stimulated noncanonical and inhibited canonical/LC3-mediated autophagosome formation in acinar cells through up-regulation of ATG4B, the cysteine protease that delipidates LC3-II.Conversely, ATG5 deficiency caused Rab9 increase in acinar cells.Inhibition of canonical autophagy in Rab9 TG pancreas was associated with accumulation of Rab9-positive vacuoles containing markers of mitochondria, protein aggregates, and trans-Golgi.The shift to the noncanonical pathway caused pancreatitis-like damage in acinar cells and aggravated experimental pancreatitis. CONCLUSIONS:The results show that Rab9 regulates pancreatic autophagy and indicate a mutually antagonistic relationship between the canonical/LC3-mediated and noncanonical/ Rab9-mediated autophagy pathways in pancreatitis.Noncanonical autophagy fails to substitute for its canonical counterpart in protecting against pancreatitis.Thus, Rab9 decrease in experimental and human pancreatitis is a protective response to sustain canonical autophagy and alleviate disease severity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,253
Écart entre enseignants0,245 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations19
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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