Dynamics and variability in the pleiotropic effects of adaptation in laboratory budding yeast populations
Notice bibliographique
Résumé
Evolutionary adaptation to a constant environment is driven by the accumulation of mutations which can have a range of unrealized pleiotropic effects in other environments. These pleiotropic consequences of adaptation can influence the emergence of specialists or generalists, and are critical for evolution in temporally or spatially fluctuating environments. While many experiments have examined the pleiotropic effects of adaptation at a snapshot in time, very few have observed the dynamics by which these effects emerge and evolve. Here, we propagated hundreds of diploid and haploid laboratory budding yeast populations in each of three environments, and then assayed their fitness in multiple environments over 1000 generations of evolution. We find that replicate populations evolved in the same condition share common patterns of pleiotropic effects across other environments, which emerge within the first several hundred generations of evolution. However, we also find dynamic and environment-specific variability within these trends: variability in pleiotropic effects tends to increase over time, with the extent of variability depending on the evolution environment. These results suggest shifting and overlapping contributions of chance and contingency to the pleiotropic effects of adaptation, which could influence evolutionary trajectories in complex environments that fluctuate across space and time.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».