Mining Fiskeby III and Mandarin (Ottawa) Expression Profiles to Understand Iron Stress Tolerant Responses in Soybean
Notice bibliographique
Résumé
L. merr) genotype Fiskeby III is highly resistant to a multitude of abiotic stresses, including iron deficiency, incurring only mild yield loss during stress conditions. Conversely, Mandarin (Ottawa) is highly susceptible to disease and suffers severe phenotypic damage and yield loss when exposed to abiotic stresses such as iron deficiency, a major challenge to soybean production in the northern Midwestern United States. Using RNA-seq, we characterize the transcriptional response to iron deficiency in both Fiskeby III and Mandarin (Ottawa) to better understand abiotic stress tolerance. Previous work by our group identified a quantitative trait locus (QTL) on chromosome 5 associated with Fiskeby III iron efficiency, indicating Fiskeby III utilizes iron deficiency stress mechanisms not previously characterized in soybean. We targeted 10 of the potential candidate genes in the Williams 82 genome sequence associated with the QTL using virus-induced gene silencing. Coupling virus-induced gene silencing with RNA-seq, we identified a single high priority candidate gene with a significant impact on iron deficiency response pathways. Characterization of the Fiskeby III responses to iron stress and the genes underlying the chromosome 5 QTL provides novel targets for improved abiotic stress tolerance in soybean.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».