CYP1A expression in freshwater fish of western New York as an indicator of pollution levels
Notice bibliographique
Résumé
Various species of freshwater fish regulate the expression of certain proteins in response to environmental contamination. Previous research has shown that CYP1A expression increases in response to contaminant levels, and can result in increased tumor formation. Fish in contaminated environments would thus benefit by downregulating the expression of CYP1A to reduce tumor prevalence as an adaptive strategy. Alternatively, regulation of the CYP1A protein in fish can serve as a bioindicator of the pollution level of an environment. This study evaluated CYP1A expression in twelve different species of freshwater fish from seven bodies of water throughout western NY including Cuba Lake, Genesee River, Hanging Bog, Love Canal, Moss Lake, Rushford Lake and Tifft Nature Preserve. Western blot analysis was used to measure CYP1A expression as a marker of site pollution and potential fish population adaptation. It was hypothesized that low CYP1A expression at a site with known contamination would suggest signs of adaptation to pollution levels present. Furthermore, if at least one sample from a species showed CYP1A expression, then the CYP1A antibody (Caymen Chemical, USA; 173132) had compatibility with that species, eliminating falsely suspected adaptation. The results from this study suggest possible adaptation of fish may be occurring in the polluted Tifft Nature Preserve and Genesee River. In contrast, CYP1A expression in fish from Cuba Lake, Hanging Bog, Love Canal, Moss Lake, and Rushford Lake appear to represent known pollution levels and adaptation is not likely occurring. Results from this study are preliminary and next steps include collection and analysis of sediment to provide a stronger correlation between pollution at sites and CYP1A expression.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».