MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3205276812 · doi:10.1038/s41438-021-00680-2

Heat-stress-induced sprouting and differential gene expression in growing potato tubers: Comparative transcriptomics with that induced by postharvest sprouting

2021· article· en· W3205276812 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueHorticulture Research · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePotato Plant Research
Établissements canadiensUniversity of New BrunswickGovernment of New BrunswickGovernment of CanadaAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaNational Natural Science Foundation of ChinaGovernment of Canada
Mots-clésSproutingPostharvestDormancyBiologyCultivarHorticultureSolanum tuberosumTranscriptomeSolanumAgronomyGerminationBotanyGeneGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Crops face increased risk from heat stress due to climate change. Potato (Solanum tuberosum L.) tubers grown in hot summers often have defects including pre-harvest sprouting ("heat sprouts"). We have used 18 potato cultivars to investigate whether heat stress (HS) conditions alone could cause heat sprouting and dormancy changes in tubers. We also examined transcriptomic responses of potato to HS and whether these responses are like those induced by postharvest sprouting. We demonstrated that HS alone caused heat sprouts and shortened postharvest dormancy period, heat-sprouted tubers became dormant after harvest, and cultivars varied substantially for producing heat spouts but there was no clear association with cultivar maturity earliness. Cultivar Innovator did not show any heat sprouts and still had long dormancy. Dormancy-associated genes (DOG1 and SLP) were downregulated in HS tubers like in postharvest sprouting tubers. We have identified 1201 differentially expressed genes, 14 enriched GO terms and 12 enriched KEGG pathways in response to HS in growing tubers of 'Russet Burbank'. Transcriptomic response of 'Russet Burbank' to HS showed significant similarities to that of postharvest non-HS sprouted tubers. Gibberellin biosynthesis pathway was enriched in heat-stressed tubers and was likely involved in heat sprouting and dormancy release. Heat sprouting and postharvest sprouting shared common candidate genes and had significant similarity in gene expression. Our study has significance for selecting potato cultivars for farming, planning storage and utilization of heat-stressed tubers, identifying sprouting-related genes, understanding heat-stress biology, and breeding heat-tolerant potato cultivars, especially for sustainable potato production under climate change.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,140
Score d'incertitude au seuil0,563

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,096
Tête enseignante GPT0,317
Écart entre enseignants0,222 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle