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Enregistrement W3205310050 · doi:10.1016/j.celrep.2021.109892

Mechanistic insights into COVID-19 by global analysis of the SARS-CoV-2 3CLpro substrate degradome

2021· article· en· W3205310050 sur OpenAlexafffund
Isabel Pablos, Yoan Machado, Hugo César Ramos de Jesus, Yasir Mohamud, Reinhild Kappelhoff, Cecilia Lindskog, Marli Vlok, Peter A. Bell, Georgina S. Butler, Peter M. Grin, Quynh Cao, Jenny Nguyen, Nestor Solis, Srinivas Abbina, Wioletta Rut, John C. Vederas, László Székely, Attila Szakos, Marcin Drąg, Jayachandran N. Kizhakkedathu, Karen Mossman, Jeremy A. Hirota, Eric Jan, Honglin Luo, Arinjay Banerjee, Christopher M. Overall

Notice bibliographique

RevueCell Reports · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSARS-CoV-2 and COVID-19 Research
Établissements canadiensUniversity of AlbertaUniversity of WaterlooMcMaster UniversitySt. Paul's HospitalUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesInstytut Biologii Medycznej Polskiej Akademii NaukCanadian Institutes of Health ResearchStockholms Läns LandstingNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaNarodowe Centrum NaukiKnut och Alice Wallenbergs StiftelseCanada Research ChairsMichael Smith Health Research BCCanada Excellence Research Chairs, Government of CanadaAgencja Badań MedycznychCanada Foundation for Innovation
Mots-clésCoronavirus disease 2019 (COVID-19)Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)2019-20 coronavirus outbreakBiologyBetacoronavirusVirologySubstrate (aquarium)MedicineEcology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Highlights d An atlas of 101 human cell substrates of SARS-CoV-2 3CL pro and 58 candidate substrates is presented d SARS-CoV-2 3CL pro redundantly targets the hippo and antiviral xenophagy pathways d Galectin-8 binds as an intracellular sensor for CoV-2 spike protein that 3CL pro cuts d Cytosolic translocation of PTBP1 from the nucleus follows proteolytic removal of an NLS

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,078
Score d'incertitude au seuil0,769

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,003
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,039
Tête enseignante GPT0,344
Écart entre enseignants0,305 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations108
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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