Understanding the role of USP11, a novel SMAD2-interacting protein, in TGF-B signalling
Notice bibliographique
Résumé
TGF-β signalling regulates various cellular activities throughout development and adulthood. Disruptions in the TGF-β signalling cascade are associated with several human diseases. SMAD2 is one of the principal effectors of TGF-β signalling. It interacts with various transcription factors, and is extensively regulated by post-translational modifications, such as ubiquitination. However, much remains unknown about the regulation of SMAD2 function. Using a proteomic screen, I identified ubiquitin-specific peptidase 11 (USP11) as a novel SMAD2 interactor. I confirmed their mutual interaction, and showed that USP11 specifically interacts with the linker domain of SMAD2, but did not appear to regulate either its stability or ubiquitination pattern. USP11 knockdown decreased TGF-β-mediated gene promoter-reporter activity, whereas USP11 over-expression potentiated it. USP11 knockdown did not, however, affect endogenous gene expression after 2 h TGF-β treatment, as determined by microarray analysis and quantitative reverse transcription PCR. I conclude that although USP11 did not regulate the stability of SMAD2, it might be involved in the regulation of other, currently unresolved, aspects of TGF-β signalling.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».