MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3205632731 · doi:10.3390/jpm11101025

Classification and Visualization of Chemotherapy-Induced Cognitive Impairment in Volumetric Convolutional Neural Networks

2021· article· en· W3205632731 sur OpenAlexaff
Kaiyi Lin, Vincent Chen, Yuan‐Hsiung Tsai, Roger S. McIntyre, Jun‐Cheng Weng

Notice bibliographique

RevueJournal of Personalized Medicine · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCancer-related cognitive impairment studies
Établissements canadiensUniversity of TorontoUniversity Health Network
Organismes subventionnairesChiayi Chang Gung Memorial HospitalMinistry of Science and Technology, TaiwanChang Gung University
Mots-clésBreast cancerCognitionMedicineRecallChemotherapyTemporal lobeCancerCognitive impairmentAudiologyDeep learningResting state fMRINeuroscienceOncologyInternal medicineRadiologyPsychologyArtificial intelligenceComputer scienceCognitive psychologyPsychiatry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Breast cancer is the most common female cancer worldwide, and breast cancer accounts for 30% of female cancers. Of all the treatment modalities, breast cancer survivors who have undergone chemotherapy might complain about cognitive impairment during and after cancer treatment. This phenomenon, chemo-brain, is used to describe the alterations in cognitive functions after receiving systemic chemotherapy. Few reports detect the chemotherapy-induced cognitive impairment (CICI) by performing functional MRI (fMRI) and a deep learning analysis. In this study, we recruited 55 postchemotherapy breast cancer survivors (C+ group) and 65 healthy controls (HC group) and extracted mean fractional amplitudes of low-frequency fluctuations (mfALFF) from resting-state fMRI as our input feature. Two state-of-the-art deep learning architectures, ResNet-50 and DenseNet-121, were transformed to 3D, embedded with squeeze and excitation (SE) blocks and then trained to differentiate cerebral alterations based on the effect of chemotherapy. An integrated gradient was applied to visualize the pattern that was recognized by our model. The average performance of SE-ResNet-50 models was an accuracy of 80%, precision of 78% and recall of 70%; on the other hand, the SE-DenseNet-121 model reached identical results with an average of 80% accuracy, 86% precision and 80% recall. The regions with the greatest contributions highlighted by the integrated gradients algorithm for differentiating chemo-brain were the frontal, temporal, parietal and occipital lobe. These regions were consistent with other studies and strongly associated with the default mode and dorsal attention networks. We constructed two volumetric state-of-the-art models and visualized the patterns that are critical for identifying chemo-brains from normal brains. We hope that these results will be helpful in clinically tracking chemo-brain in the future.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,093
Score d'incertitude au seuil0,536

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,034
Tête enseignante GPT0,339
Écart entre enseignants0,305 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Personalized MedicineMême sujetCancer-related cognitive impairment studiesTravaux en français237 207