Resistance of <scp>SARS‐CoV</scp>‐2 beta and gamma variants to plasma collected from Canadian blood donors during the spring of 2020
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background This pilot study assesses the ability of plasma collected from Canadian blood donors in the first wave of the SARS‐CoV‐2 pandemic to neutralize later SARS‐CoV‐2 variants of concern (VOCs). Study design and methods A repeated cross‐sectional design was used, and a random cross‐sectional sample of all available Canadian Blood Services retention samples (n = 1500/month) was drawn monthly for April and May of 2020. Qualitative IgG analysis was performed on aliquots of specimens using anti‐spike, anti‐receptor binding domain, and anti‐nucleocapsid protein enzyme‐linked immunosorbent assays as well as the Abbott Architect SARS CoV‐2 IgG assay (Abbott Laboratories) against the anti‐nucleocapsid protein. Selected plasma specimens were then assessed for neutralization against VOCs using pseudotyped lentivirus inhibition assays as well as plaque reduction neutralization test 50% (PRNT50). Results Six specimens with a high neutralizing titer against wild‐type SARS‐CoV‐2 and three specimens with a low neutralizing titer against wild‐type SARS‐CoV‐2 were chosen for further analysis against VOCs. Four of six high neutralizing titer specimens had a reduced neutralizing capacity against beta VOCs by both neutralization methods. Three of six high neutralizing titer specimens had reduced neutralization capacity against gamma VOCs. Conclusions This preliminary data can be used as a justification for limiting the use of first wave plasma products in upcoming clinical trials but cannot be used to speculate on general trends in the immunity of Canadian blood donors to SARS‐CoV‐2.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».