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Enregistrement W3205799388 · doi:10.1016/j.psj.2021.101532

Plasma metabolomic profiling reveals potential onset of lay biomarkers in broiler breeders

2021· article· en· W3205799388 sur OpenAlexaff
Mohammad Afrouziyeh, Nicole M. Zukiwsky, D.R. Korver, M.J. Zuidhof

Notice bibliographique

RevuePoultry Science · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMetabolomics and Mass Spectrometry Studies
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMetabolomicsMetabolomeBroilerGompertz functionAnimal scienceSexual maturityBiologyInternal medicineEndocrinologyMedicineBioinformaticsMathematics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Changes in the metabolic fingerprint of plasma during the onset of lay in broiler breeders were investigated. We used metabolomics to identify biomarkers of sexual maturity and to provide a comprehensive understanding of breeder metabolome during the pullet to hen transition period. A total of 36 pullets were used, in which 30 pullets were randomly assigned to one of 10 unique growth trajectories and 6 birds were assigned to an unrestricted group. The growth trajectories were designed using a 3-phase Gompertz growth model with 10 levels of BW gain in the prepubertal and pubertal growth phases ranging from the breeder-recommended target BW to 22.5% higher, in 2.5% increments. The BW trajectories were applied to each individual bird using a precision feeding (PF) system, which collected BW and feed intake data for each individual bird. The birds were classified based on age at first egg (AFE), and 12 pullets were chosen from the lower and upper AFE extremes (early and late onset of lay) at 18, 20, 22, 24, and 26 wk of age to run repeated blood plasma metabolomic assays. The metabolomic profile data were collected using a direct-injection liquid chromatography-tandem mass spectrometry and steroid assays. Univariate analysis identified 87 differential metabolites between the early- and late-onset of lay groups at 24 wk of age and 104 differential metabolites between the pullet and hen groups. Further investigation of differential metabolites showed 15 potential biomarkers for pullet to hen transition by analyzing the receiver operating characteristic (ROC) curve, mainly consisting of carnitine and choline metabolites. Differential metabolites during the pullet to hen transition were mainly associated with lipid, energy, and amino acid metabolism pathways, which gave clues to the physiological and metabolic shifts resulting from sexual maturation. At 24 wk of age, the main pathways involved in differentiation of the early- and late-onset of lay groups were related to lipid and amino acid metabolism. These metabolites could be involved in biosynthesis of egg yolk precursors in the liver.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,027
Score d'incertitude au seuil0,506

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,256
Écart entre enseignants0,247 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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