MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W3205879351 · doi:10.1101/2021.10.08.463358

EXTRA LARGE G-PROTEIN 2 (XLG2) mediates cell death and hyperimmunity via a novel, apoplastic ROS-independent pathway in <i>Arabidopsis thaliana</i>

2021· preprint· en· W3205879351 sur OpenAlexfundno aff
Elena Petutschnig, Julia Anders, Marnie Stolze, Christopher Meusel, Ronja Hacke, Melina Schwier, Anna-Lena Gippert, Samuel Kroll, Patrick Faßhauer, Marcel Wiermer, Volker Lipka

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant-Microbe Interactions and Immunity
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesInstitute of GeneticsInstitute of Genetics and Developmental Biology, Chinese Academy of SciencesChinese Academy of SciencesDeutsche Forschungsgemeinschaft
Mots-clésBiologyArabidopsisCell biologyMutantArabidopsis thalianaProgrammed cell deathHeterotrimeric G proteinSignal transductionPhosphorylationProtein subunitGeneticsGeneG proteinApoptosis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Heterotrimeric G-Proteins are signal transduction complexes comprised of three subunits, Gα, Gβ and Gγ, and are involved in many aspects of plant life. The non-canonical Gα subunit XLG2 mediates PAMP-induced ROS generation and immunity downstream of PRRs. A mutant of the chitin receptor component CERK1, cerk1 -4, maintains normal chitin signalling capacity, but shows excessive cell death upon infection with powdery mildews. We identified XLG2 mutants as suppressors of the cerk1 -4 phenotype. We generated stably transformed Arabidopsis lines expressing Venus-XLG2 and numerous mutated variants. These were analysed by confocal microscopy, Western blotting and pathogen infection. We also crossed cerk1 -4 with several mutants involved in immunity and analysed their phenotype. Phosphorylation of XLG2 was investigated by quantitative proteomics. Mutations in XLG2 complex partners AGB1 and AGG1 have a partial cerk1 -4 suppressor effect. The cerk1 -4 phenotype is independent of NADPH oxidase-generated ROS, BAK1 and SOBIR1, but requires PUB2. XLG2 mediates cerk1 -4 cell death at the cell periphery. Integrity of the XLG2 N-terminal domain, but not its phosphorylation, is essential for correct XLG2 localisation and cerk 1-4 signalling. Our results suggest that XLG2 transduces signals from an unknown cell surface receptor that activates an apoplastic ROS-independent cell death pathway in Arabidopsis .

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,195
Écart entre enseignants0,179 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)→Même sujetPlant-Microbe Interactions and Immunity→Travaux en français237 207→