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Enregistrement W3206084706 · doi:10.1161/circ.132.suppl_3.18802

Abstract 18802: Transcriptome Profiles of Chronically Closed or Cycling Aortic Valve Leaflets are Highly Similar Compared to Chronically Open Valves: Distention Drives Leaflet Homeostasis

2015· article· en· W3206084706 sur OpenAlexaff
Katsuhide Maeda, Xiaoyuan Ma, Frank L. Hanley, R. Kirk Riemer

Notice bibliographique

RevueCirculation · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCardiac Valve Diseases and Treatments
Établissements canadiensMerck Canada Inc. (Canada)
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAortic valveTranscriptomeMedicineCardiologyHomeostasisInternal medicineLeaflet (botany)Heart valveAnatomyGene expressionBiologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Introduction: Throughout the valve cycle mechanical forces of multiple types and intensities are exerted on the leaflets, sinus and annulus. The mechanisms through which these forces regulate the homeostatic maintenance of valve leaflet architecture are still poorly understood. Ventricular mechanical support with a continuous flow device results in chronic closure of the outflow valve. Whether chronic valve closure affects valve leaflet homeostasis is a significant but unsettled clinical concern. Hypothesis: We asked if chronic closure of the aortic valve (AV) impairs leaflet homeostasis by comparing the transcriptome profiles of AV cultured under different mechanical force conditions: Normally cycling (Flow); Not cycling but open (Static); or Not cycling but closed (Static-Closed, SC). Methods: Ex vivo culture of native rat aortic valves, (8 valves per bioreactor, 4 valves per condition) was conducted in a flow bioreactor for seven days at 37C in endothelial cell culture media under conditions approximating the normal stroke volume of the rat heart. In each of 4 independent experiments, flow-induced valve cycling (Flow) was compared with either Static or SC condition in paired groups. After culture, leaflets were dissected from 3 valves/condition and pooled, mRNA was extracted and expression was evaluated using whole genome microarrays. Results: Statistical-based unsupervised hierarchical clustering analysis of the leaflet transcriptome profiles revealed only two distinct patterns of leaflet gene expression between the three groups of AV. Flow and SC groups had nearly identical profiles whereas the Static valve group was distinctly different (p<0.05). Conclusions: These results reveal that the stretching of valve leaflets by a filling volume inducing full coaptation is apparently sufficient to largely preserve their architecture and phenotypic gene expression in the seven day culture period tested. In contrast, the absence of valve closure produces a markedly different pattern of gene expression. Therefore, the absence of flow through the closed AV valve does not appear to be inherently destructive compared with conditions in which the valve remains open.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,068
Tête enseignante GPT0,374
Écart entre enseignants0,306 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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