MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W32061181 · doi:10.1002/pmic.201900352

Involvement and contribution to virulence of Endo-Beta-1,4-Xilanases of Fusarium Graminearum during host infection

2013· article· en· W32061181 sur OpenAlexfundno aff
Katia Gazzetti

Notice bibliographique

RevuePROTEOMICS · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueMycotoxins in Agriculture and Food
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésXylanaseFusariumBiologyGlumeMycotoxinMicrobiologyPichia pastorisBotrytis cinereaTrichotheceneVirulenceGeneFood scienceBotanyBiochemistryEnzymeRecombinant DNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Liquid Chromatography coupled to Tandem Mass Spectrometry (LC-MS/MS) based methods are currently the top choice for high-throughput, quantitative measurements of the proteome. While traditional proteomics LC-MS/MS methods can suffer from issues such as low reproducibility and quantitative accuracy due to its stochastic nature, recent improvements in acquisition protocols have resulted in methods that can overcome these challenges. Data-independent acquisition (DIA) is a novel mass spectrometric method that does so by using a deterministic acquisition strategy. These new approaches will allow researchers to apply MS on more complex samples, however, existing heuristic and expert-knowledge based methods will struggle with keeping pace of the increasing complexity of the resulting data. Deep learning (DL) based methods have been shown to be more adept at handling large amounts of complex data than traditional methods in many other fields, such as computer vision and natural language processing. Proteomics is also entering a phase where the size and complexity of the data will require us to look towards scalable and data-driven DL pipelines.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,281
Score d'incertitude au seuil0,133

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,193
Écart entre enseignants0,183 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuePROTEOMICSMême sujetMycotoxins in Agriculture and FoodTravaux en français237 207