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Enregistrement W3206242311 · doi:10.1787/56e9bbf0-en

Adverse Outcome Pathway on Cyp2E1 activation leading to liver cancer

2021· report· en· W3206242311 sur OpenAlexaff
Francina Webster, Iain B. Lambert, Carole L. Yauk

Notice bibliographique

RevueOECD series on adverse outcome pathways · 2021
Typereport
Langueen
DomainePharmacology, Toxicology and Pharmaceutics
ThématiquePharmacogenetics and Drug Metabolism
Établissements canadiensCarleton UniversityUniversity of OttawaHealth Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCYP2E1Oxidative stressReactive oxygen speciesChemistryCytochrome P450Reactive intermediateLiver injuryCytotoxicityBiochemistryCancer researchCell biologyPharmacologyMetabolismBiologyCatalysisIn vitro

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The present AOP describes the prolonged activation of Cyp2E1 resulting in liver cancer. Cyp2E1 is a cytochrome P450 mono-oxygenase that bioactivates over 85 substrates, thereby creating electrophilic metabolites and oxidative stress. Mono-oxygenation of these substrates to their reactive metabolites, and the accompanying oxidative stress produced during metabolism, pose health risks because they lead to hepatotoxicity and, often, to liver cancer. The MIE occurs when Cyp2E1 binds a substrate. The Cyp2E1 catalytic cycle is prone to decoupling, which produces oxidative stress (KE1), and mono-oxidation of substrates produces reactive metabolites. Both reactive oxygen species and metabolites cause cytotoxicity (KE2). However, following injury, the liver is able to regenerate itself through an increase in cellular proliferation (KE3). Under conditions of chronic activation of Cyp2E1, excessive chronic increases in levels of reactive oxygen species and cell death, and subsequent dysregulated cellular proliferation, leads to tumour formation (AO).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Théorique ou conceptuel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,020
Score d'incertitude au seuil0,067

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0200,005

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,306
Tête enseignante GPT0,472
Écart entre enseignants0,166 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeThéorique ou conceptuel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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