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Enregistrement W3206292757 · doi:10.2174/1875036202114010063

Unsupervised Clustering in Epidemiological Factor Analysis

2021· article· en· W3206292757 sur OpenAlexaff
Serge Dolgikh

Notice bibliographique

RevueThe Open Bioinformatics Journal · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMathematics
ThématiqueCOVID-19 epidemiological studies
Établissements canadiensSolana Networks (Canada)
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEpidemiologyPrincipal component analysisEpidemiological methodDimensionality reductionCluster analysisComputer scienceArtificial intelligenceStatisticsData miningMachine learningMedicineMathematicsPathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: The analysis of epidemiological data at an early phase of an epidemiological situation, when the confident correlation of contributing factors to the outcome has not yet been established, may present a challenge for conventional methods of data analysis. Objective: This study aimed to develop approaches for the early analysis of epidemiological data that can be effective in the areas with less labeled data. Methods: An analysis of a combined dataset of epidemiological statistics of national and subnational jurisdictions, aligned at approximately two months after the first local exposure to COVID-19 with unsupervised machine learning methods, including principal component analysis and deep neural network dimensionality reduction, to identify the principal factors of influence was performed. Results: The approach and methods utilized in the study allow to clearly separate milder background cases from those with the most rapid and aggressive onset of the epidemics. Conclusion: The findings can be used in the evaluation of possible epidemiological scenarios and as an effective modeling approach to identify possible negative epidemiological scenarios and design corrective and preventative measures to avoid the development of epidemiological situations with potentially severe impacts.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,009
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,034
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,047

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0090,034
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,003
Bibliométrie0,0080,005
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0020,002
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,402
Tête enseignante GPT0,466
Écart entre enseignants0,065 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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