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Enregistrement W3206790774 · doi:10.1186/s40101-021-00267-9

Upregulation of cathepsin L gene under mild cold conditions in young Japanese male adults

2021· article· en· W3206790774 sur OpenAlexfundno aff
Yoshiki Yasukochi, Sora Shin, Hitoshi Wakabayashi, Takafumi Maeda

Notice bibliographique

RevueJournal of PHYSIOLOGICAL ANTHROPOLOGY · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueThermal Regulation in Medicine
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesInstitute of GeneticsJapan Society for the Promotion of Science
Mots-clésDownregulation and upregulationGenePsychologyMedicineGeneticsBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Physiological thermoregulatory systems in humans have been a key factor for adaptation to local environments after their exodus from Africa, particularly, to cold environments outside Africa. Recent studies using high-throughput sequencing have identified various genes responsible for cold adaptation. However, the molecular mechanisms underlying initial thermoregulation in response to acute cold exposure remain unclear. Therefore, we investigated transcriptional profiles of six young Japanese male adults exposed to acute cold stress. Methods In a climatic chamber, the air temperature was maintained at 28°C for 65 min and was then gradually decreased to 19°C for 70 min. Saliva samples were obtained from the subjects at 28°C before and after 19°C cold exposure and were used for RNA sequencing. Results In the cold exposure experiment, expression levels of 14 genes were significantly changed [false discovery rate (FDR) < 0.05] although the degree of transcriptional changes was not high due to experimental conditions or blunted transcriptional reaction in saliva to cold stress. As a result, differential gene expression analyses detected the cathepsin L ( CTSL ) gene to be significantly upregulated, with FDR < 0.05 and log 2 fold change value > 1; thus, this gene was identified as a differentially expressed gene. Given that the cathepsin L protein is related to invasion of the novel coronavirus (SARS-CoV-2), mild cold stress might alter the susceptibility to coronavirus disease-19 in humans. The gene ontology enrichment analysis for 14 genes with FDR < 0.05 suggested that immune-related molecules could be activated by mild cold stress. Conclusions The results obtained from this study indicate that CTSL expression levels can be altered by acute mild cold stress.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,922
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,338
Écart entre enseignants0,309 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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