Shared evolutionary trajectories of three independent neo-sex chromosomes in <i>Drosophila</i>
Notice bibliographique
Résumé
Dosage compensation (DC) on the X Chromosome counteracts the deleterious effects of gene loss on the Y Chromosome. However, DC is not efficient if the X Chromosome also degenerates. This indeed occurs in Drosophila miranda , in which both the neo-Y and the neo-X are under accelerated pseudogenization. To examine the generality of this pattern, we investigated the evolution of two additional neo-sex chromosomes that emerged independently in D. albomicans and D. americana and reanalyzed neo-sex chromosome evolution in D. miranda . Comparative genomic and transcriptomic analyses revealed that the pseudogenization rate on the neo-X is also accelerated in D. albomicans and D. americana although to a lesser extent than in D. miranda . In males, neo-X-linked genes whose neo-Y-linked homologs are pseudogenized tended to be up-regulated more than those whose neo-Y-linked homologs remain functional. Moreover, genes under strong functional constraint and genes highly expressed in the testis tended to remain functional on the neo-X and neo-Y, respectively. Focusing on the D. miranda and D. albomicans neo-sex chromosomes that emerged independently from the same autosome, we further found that the same genes tend to become pseudogenized in parallel on the neo-Y. These genes include Idgf6 and JhI - 26 , which may be unnecessary or even harmful in males. Our results indicate that neo-sex chromosomes in Drosophila share a common evolutionary trajectory after their emergence, which may prevent sex chromosomes from being an evolutionary dead end.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».