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Enregistrement W3207294468 · doi:10.17863/cam.75708

The future of zoonotic risk prediction

2021· article· en· W3207294468 sur OpenAlexaff
Colin J. Carlson, Maxwell J. Farrell, Zoë Grange, Barbara A. Han, Nardus Mollentze, Alexandra Phelan, Angela L. Rasmussen, Gregory F. Albery, Bernard Bett, David M. Brett‐Major, Lily Cohen, Tad Dallas, Evan A. Eskew, Anna C. Fagre, Kristian M. Forbes, Rory Gibb, Sam Halabi, C Hammer, Rebecca Katz, Jason Kindrachuk, Renata L. Muylaert, Felicia B. Nutter, Joseph Ogola, Kevin J. Olival, Michelle Rourke, Sadie J. Ryan, Noam Ross, Stephanie N. Seifert, Tarja Sironen, Claire J. Standley, Kishana Taylor, Marietjie Venter, Paul W. Webala

Notice bibliographique

RevueGraduate Medical Education Research Journal · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueZoonotic diseases and public health
Établissements canadiensUniversity of ManitobaUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesDirectorate for Biological SciencesWellcome TrustGeorgetown University
Mots-clésPandemicGlobeGlobal healthCoronavirus disease 2019 (COVID-19)One HealthData scienceInfectious disease (medical specialty)Environmental planningComputer scienceGeographyPolitical scienceDiseasePublic healthMedicineHealth care

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

(Uploaded by Plazi for the Bat Literature Project) In the light of the urgency raised by the COVID-19 pandemic, global investment in wildlife virology is likely to increase, and new surveillance programmes will identify hundreds of novel viruses that might someday pose a threat to humans. To support the extensive task of laboratory characterization, scientists may increasingly rely on data-driven rubrics or machine learning models that learn from known zoonoses to identify which animal pathogens could someday pose a threat to global health. We synthesize the findings of an interdisciplinary workshop on zoonotic risk technologies to answer the following questions. What are the prerequisites, in terms of open data, equity and interdisciplinary collaboration, to the development and application of those tools? What effect could the technology have on global health? Who would control that technology, who would have access to it and who would benefit from it? Would it improve pandemic prevention? Could it create new challenges? This article is part of the theme issue 'Infectious disease macroecology: parasite diversity and dynamics across the globe'.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,009
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,042
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Théorique ou conceptuel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,097
Score d'incertitude au seuil0,325

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0090,042
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0070,004
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0070,013
Science ouverte0,0020,004
Intégrité de la recherche0,0030,004
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0970,035

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,065
Tête enseignante GPT0,430
Écart entre enseignants0,365 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeThéorique ou conceptuel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
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Résumé présentoui

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