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Enregistrement W3207303449 · doi:10.22541/au.158801945.58822703

The effects of host genetic architecture on the gut microbiome composition of Chinook salmon (Oncorhynchus tshawytscha)

2020· dataset· en· W3207303449 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueAuthorea · 2020
Typedataset
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGut microbiota and health
Établissements canadiensUniversity of Windsor
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyMicrobiomeOncorhynchusPopulationChinook windHost (biology)ZoologyEcologyGeneticsFisheryFish <Actinopterygii>

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The microbiome community consists of microbes living in or on an organism and has been implicated in both host health and function. Environmental and host-related drivers of the microbiome have been studied in many fish species, but the role of the host genetic architecture across populations and among-families within a population is not well characterized. Here, Chinook salmon (Oncorhynchus tshawytscha) were used to determine inter-population differences and additive genetic variation within populations for gut microbiome diversity and composition. Specifically, hybrid stocks of Chinook salmon were created by crossing males from eight populations with eggs from an inbred line of self-fertilized hermaphrodite salmon. Based on high-throughput sequencing of the 16S rRNA gene, significant gut microbiome community diversity and composition differences were found among the hybrid stocks. These differences likely reflect divergent selection shaping the gut microbiome and its co-evolution with the host. Furthermore, additive genetic variance components varied among hybrid stocks, indicative of population-specific heritability patterns, suggesting the potential to select for specific gut microbiome composition for aquaculture purposes. Determining the role of host genetics in shaping their gut microbiome has important implications for predicting population responses to environmental changes and will thus impact conservation efforts for declining populations of Chinook salmon.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: Jeu de données
Score de désaccord entre enseignants0,261
Score d'incertitude au seuil0,830

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,238
Écart entre enseignants0,232 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle