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Enregistrement W3207407512 · doi:10.26434/chemrxiv.14065025.v1

Limited Hydrolysis of Polysialic Acid by Human Neuraminidase Enzymes

2021· preprint· en· W3207407512 sur OpenAlexafffund
Carmanah D. Hunter, Christopher W. Cairo

Notice bibliographique

RevueChemRxiv · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGlycosylation and Glycoproteins Research
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaAlberta Glycomics CentreUniversity of Alberta
Mots-clésPolysialic acidSialic acidNeuraminidaseBiochemistryChemistrySialidaseHydrolysisEnzymeGlycanGlycoproteinCellNeural cell adhesion moleculeCell adhesion

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Regulation of sialic acids by human neuraminidase (hNEU) enzymes is important to many biological processes. Defining hNEU substrate tolerance can help to elucidate the roles of these enzymes in regulating sialosides in human health and disease. Polysialic acid (polySia) is a polyanion of α(2→8) linked sialic acids with roles in nervous, reproductive, and immune systems and is dysregulated in some malignancies and mental disorders. The unique chemical properties of this polymer, which include an enhanced susceptibility to acid-catalyzed hydrolysis, have hampered its study. Herein we describe the first systematic study of hNEU isoenzyme activity towards polysialic acid in vitro. The experimental design allowed us to study the impact of several factors that may influence polysialic acid degradation including pH, polymer size, and the relative ionic strength of the surrounding media. We report that short chains of polysialic acid (degree of polymerization, DP 3-8) were substrates of NEU3 and NEU4 at acidic pH, but not at neutral pH. No hNEU-catalyzed hydrolysis of longer polymers (DP 10-20) was detected. These findings suggest a neuraminidase-independent mechanism for polysialic acid turnover such as internalization and degradation in endosomes and lysosomes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,287
Écart entre enseignants0,269 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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