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Enregistrement W3207557942 · doi:10.1101/2021.10.07.21264710

ATP-citrate lyase as a therapeutic target in chronic kidney disease: a Mendelian Randomization analysis

2021· preprint· en· W3207557942 sur OpenAlexafffund
Pedrum Mohammadi‐Shemirani, Michael Chong, Nicolas Perrot, Marie Pigeyre, Gregory R. Steinberg, Guillaume Paré, Joan C. Krepinsky, Matthew B. Lanktree

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Associations and Epidemiology
Établissements canadiensSt. Joseph’s Healthcare HamiltonImpactThrombosis and Atherosclerosis Research InstituteMcMaster UniversityPopulation Health Research Institute
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchKidney Foundation of CanadaCanadian Society of NephrologyDiabetes CanadaAmgenMcMaster UniversitySanofiBristol-Myers Squibb
Mots-clésMendelian randomizationKidney diseaseDyslipidemiaMedicineInternal medicineBiologyEndocrinologyMicroalbuminuriaRenal functionDiabetes mellitusBioinformaticsGeneticsGenotypeGeneGenetic variants

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background ATP-citrate lyase (ACLY) inhibition is a promising therapeutic target for dyslipidemia, atherosclerotic cardiovascular disease, non-alcoholic steatohepatitis, and metabolic syndrome. Genetic analysis of its role in chronic kidney disease (CKD) has not been performed. Methods We constructed a genetic instrument by selecting variants associated with ACLY expression level in the expression quantitative trait loci genetics consortium (eQTLGen) that includes blood samples from 31,684 participants. In a two-sample Mendelian randomization analysis, we then evaluated the effect of genetically predicted ACLY expression on risk of CKD, estimated glomerular filtration rate (eGFR), and microalbuminuria using the CKD Genetics consortium (CKDGen), United Kingdom biobank, and the Finnish Genetics consortium (FinnGen) totaling 66,396 CKD cases and 958,517 controls. Results ACLY is constitutively expressed in all cell types including in whole blood. The genetic instrument included 13 variants and explained 1.5% of variation in whole blood ACLY gene expression. A 34% reduction in genetically predicted ACLY expression was associated with a 0.04 mmol/L reduced low-density lipoprotein cholesterol ( P = 3.4 × 10 −4 ) and a 9% reduced risk of CKD (stage 3,4,5, dialysis or eGFR below 60 ml/min/1.73m 2 ) (OR = 0.91, 95% C.I. 0.85-0.98, P = 0.008), but no association was observed with eGFR nor microalbuminuria. Conclusion Mendelian Randomization analysis provides cautious optimism regarding the possibility of ACLY as a therapeutic target for CKD.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,048
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,053
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,048
Score d'incertitude au seuil0,253

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0480,053
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0030,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0050,008
Bibliométrie0,0030,003
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0030,001
Intégrité de la recherche0,0030,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0070,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,281
Écart entre enseignants0,268 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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