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Enregistrement W3207635519 · doi:10.3389/fphar.2021.714790

An In-Silico, In-Vitro and In-Vivo Combined Approach to Identify NMNATs as Potential Protein Targets of ProEGCG for Treatment of Endometriosis

2021· article· en· W3207635519 sur OpenAlexaff
Sze Wan Hung, Bo Liang, Yating Gao, Ruizhe Zhang, Zhouyurong Tan, Tao Zhang, Jacqueline Pui Wah Chung, Tak Hang Chan, Chi Chiu Wang

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Pharmacology · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueEndometriosis Research and Treatment
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesHealth and Medical Research FundNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésIn silicoIn vivoEndometriosisIn vitroChemistryPharmacologyBiochemistryBiologyCancer researchMedicinePathologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Endometriosis is defined as endometrial tissues found outside the uterine cavity. ProEGCG is a prodrug of Epigallocatechin gallate (EGCG), a potent polyphenol found in green tea. It inhibits the development of endometriotic lesions of mouse model in vivo , with higher efficacy and more remarkable anti-oxidative ability than EGCG. Our study aims to identify the molecular binding targets and pharmacological actions of ProEGCG in treating endometriosis. Protein target interaction study is essential to fully characterize the mechanism of actions, related therapeutic effects, and side effects. We employed a combined approach, starting with an in silico reverse screening of protein targets and molecular docking, followed by in vitro cellular thermal shift assay (CESTA) to assess the stability of protein-small molecule complexes. Then microarray and immunostaining of endometriotic lesions in mice in vivo confirmed the molecular interaction of the selected targets after treatment. Our study identified enzymes nicotinamide nucleotide adenylyltransferase (NMNAT)1 and NMNAT3 as protein targets of ProEGCG in silico and in vitro and were overexpressed after ProEGCG treatment in vivo . These findings suggested that participation in nicotinate and nicotinamide metabolism potentially regulated the redox status of endometriosis via its antioxidative capacities through binding to the potential therapeutic targets of ProEGCG.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,357
Écart entre enseignants0,336 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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