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Enregistrement W3207973054 · doi:10.2503/hortj.utd-313

Localized Repression of Two bHLH Genes is Involved in the Formation of White Margins and White Abaxial Surfaces in Carnation Petals by Inducing the Absence of Anthocyanin Synthesis

2021· article· en· W3207973054 sur OpenAlexfundno aff
Ayumi Deguchi, Fumi Tatsuzawa, Kotaro Ishii, Tomoko Abe, K. Miyoshi

Notice bibliographique

RevueThe Horticulture Journal · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Gene Expression Analysis
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesInstitute of GeneticsRIKEN
Mots-clésPetalBiologyWhite (mutation)AnthocyaninBotanyCarnationGeneCultivarDianthusPetuniaGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Flower color patterns are attractive traits of floricultural plants. However, the mechanisms underlying these traits remain mostly unknown. Carnation (Dianthus caryophyllus L.) and interspecific hybrids thereof exhibit many flower color patterns involving white margins on reddish petals, as observed in the cultivar ‘Minerva’. Flowers with white margins also have white abaxial surfaces. We studied the factors regulating the formation of white margins and a white abaxial surface in flowers through analyses of pigments and related gene expression. HPLC analysis revealed an absence of anthocyanins in white margins, although the accumulation of other flavonoid pigments (flavonols) was almost identical between the dark-red central and white marginal regions of petals. RNA-seq analyses of the dark red central regions and white marginal regions of ‘Minerva’ petals resulted in the extraction of 18 genes related to anthocyanin biosynthesis and transportation, including some transcription factors, as candidate regulatory genes for the formation of white margins. Further analysis of the expression of these genes by real-time RT-PCR and a comparison of two white-margin-flowered cultivars and three red-unicolor-flowered cultivars indicated that the expressions of two bHLH transcription factor genes and seven structural genes were positively correlated with anthocyanin accumulation. Although DcbHLH1, which is a homolog of JAF13 in Petunia ×hybrida, was expressed in both flower color groups, DcbHLH2, a homolog of AN1, was expressed only in white-marginal-flowered cultivars. Moreover, in the petals of ‘Minerva’, the expression of those nine genes was repressed in the abaxial epidermal layer without red pigmentation conferred by anthocyanins. Therefore, we could postulate that the localized repression of both bHLH genes is involved in the formation of white margins in carnation petals by inducing the absence of anthocyanin synthesis and that the white abaxial surface of the petals may result from similar regulatory mechanisms. In particular, DcbHLH2 could act as a key gene because of its restricted expression only in cultivars with white-margined flowers.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,187

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,256
Écart entre enseignants0,246 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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