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Enregistrement W3208114187

Long non-coding RNAs Profiling of Qingke Barley in Tibet under the Condition of Blumeria graminis Infection

2020· article· en· W3208114187 sur OpenAlexvenueno aff
Lingling Wei, Yulin Wang, Hongjun Yuan, Mu Wang, Xingquan Zeng

Notice bibliographique

RevueTriticeae Genomics and Genetics · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueWheat and Barley Genetics and Pathology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBlumeria graminisPowdery mildewBiologyGeneGeneticsPlant disease resistanceCell biologyBotany
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Powdery mildew, known as  one of the most devastating diseases in cereal crops, causes serious losses in grain yield and quality. In order to clarify the pathogenic molecular mechanism of qingke barley to powdery mildew, In the present study, the DEGs expression patterns of Tibetan barley (also called qingke) cultivars G7 (showed complete penetration resistance to powdery mildew) and Z13 (showed complete penetration sensitivity to powdery mildew) were compared after inoculation with  Blumeria graminis  f. sp.  Hordei  ( Bgh ). The genes coding for calcium-dependent protein kinase, glutathione S-transferase, plasminogen activator inhibitor 1, serine-type endopeptidase, and MADS-box transcription factor were expressed at higher levels in the G7, indicating their possible roles in the resistance to  Bgh . The highly expressed genes in G7 take a part in the biological processes including ion channels, calcium-dependent protein kinase, and plant hormone pathway. Sixteen lncRNAs and their 21 candidate target genes were identified to exhibit coordinated expression patterns, which were enriched in plant hormone signal transduction and ion binding processes. This study casts an insight into the molecular mechanisms to control powdery mildew in barley and relative species.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,624
Score d'incertitude au seuil0,170

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,242
Écart entre enseignants0,214 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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