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Enregistrement W3208295991 · doi:10.1107/s0108767321097130

Structural comparison of <i>Faecalibacterium prausnitzii</i> α-glycosidases and sucrase-isomaltase

2021· article· en· W3208295991 sur OpenAlexaff
Anna Jewczynko, David R. Rose

Notice bibliographique

RevueActa Crystallographica Section A Foundations and Advances · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDigestive system and related health
Établissements canadiensUniversity of Waterloo
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésFaecalibacterium prausnitziiChemistryBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The human gastrointestinal system is home to a very diverse microbiome that is made up of approximately 100 trillion microorganisms. This microbiome has a significant impact on human health, as it can influence the immune system, the central nervous system and the body's metabolism. Faecalibacterium prausnitzii is one of the most abundant microorganisms found in a healthy gut, where it makes up about 5% of the microbiome. This gastrointestinal microorganism produces 2 enzymes belonging to the glycoside hydrolase family 31, which will be referred to as Fp-G1 and Fp-G2. These -glycosidases have notable structural similarities to the N-terminal subunit of sucrase-isomaltase. Sucrase-Isomaltase (SI) is a gastrointestinal enzyme found in humans, and is responsible for hydrolyzing carbohydrates with -1,6, -1,4 and -1,2 glycosidic bonds. The objective of this project is to compare the enzymatic activity of F. prausnitzii -glycosidases to the N-terminal subunit of SI, in order to investigate the structural similarities between the proteins. Real time kinetic assays and computational models will be used to identify structural features contributing to the differences in substrate affinity. These investigations into protein structure and enzymatic activity of the -glucosidase proteins will provide a clearer insight on the structure and function of the Fp-G1, Fp-G2, and SI.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,862
Score d'incertitude au seuil0,454

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,294
Écart entre enseignants0,282 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
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