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Enregistrement W3208385442 · doi:10.1093/ajcp/aqab191.305

Complete response of a colonic high-grade neuroendocrine carcinoma to platinum-based therapy: Insights from comprehensive genomic profiling

2021· article· en· W3208385442 sur OpenAlexaff
R. D. Wood, Thomas Arnason, Ryan DeCoste, Daniel Gaston, M D Carter, Daniel Rayson

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Clinical Pathology · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueNeuroendocrine Tumor Research Advances
Établissements canadiensQueen Elizabeth II Health Sciences Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBAP1MedicineMicrosatellite instabilityColorectal cancerOncologyInternal medicineTargeted therapyCancerCancer researchGeneBiologyGeneticsMicrosatellite

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Introduction/Objective Comprehensive genomic profiling (CGP) is an essential tool in precision medicine, providing diagnostic, prognostic, and predictive (therapeutic) information to enable personalized and optimized care for cancer patients. We present the case of a patient with a metastatic high-grade tumor of the colon who showed an impressive response to systemic therapy and discuss the role of CGP in cancer management. Methods/Case Report A 54-year-old woman with was diagnosed with stage IV large-cell neuroendocrine carcinoma (LCNEC) of the colon with large volume liver and nodal metastases with imminent hepatic failure. CGP was performed on the resected tumor (TSO500 panel, 523 cancer-related genes, Illumina), showing pathogenic mutations in multiple oncogenes and tumor suppressor genes, including BRCA1, BAP1, and BRAF. Additionally, global parameters revealed a very high tumor mutation burden (TMB, 351 / Mb), and high-degree microsatellite instability (MSI-H). Treatment of the patient’s metastases with platinum-based systemic therapy resulted in a complete radiographic response, with no evidence of disease recurrence after 6.5 years. This type of complete response to therapy is rarely reported in colonic LCNEC. Assessment by Medical Genetics did not identify a germline mutation suggestive of hereditary breast/ovarian cancer or Lynch syndrome. Results (if a Case Study enter NA) NA Conclusion The patient’s extraordinary response to therapy is likely due to loss of BRCA1 and/or BAP1 function, as deleterious mutations in both genes predict sensitivity to platinum-based therapy through exploitation of deficient homologous recombination repair (HRR). The high TMB and MSI-H status suggest the immune system may have contributed to tumor clearance through neoantigen activation of T-cells. The information provided by CGP also suggested potential tumor sensitivity to poly(ADP-Ribose) polymerase inhibitors (PARPi), immunotherapy (IT), and BRAF/MEK inhibitor therapy, should the tumor recur. This case highlights the value of CGP in guiding management of rare and aggressive tumors.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,785
Score d'incertitude au seuil0,894

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,079
Tête enseignante GPT0,399
Écart entre enseignants0,320 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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