MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3208404570 · doi:10.14288/ujemi.v25i.193275

Biofilm production in Escherichia coli K30 with group 1 capsular gene wza and wza-wzb-wzc deletions is not correlated with Erythromycin resistance phenotypes in liquid media

2020· article· en· W3208404570 sur OpenAlexaff
Cynthia A. James, Christine Kim, Catherine Pan, Douglas Zhong

Notice bibliographique

RevueOpen Collections · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial Genetics and Biotechnology
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiofilmBiologyErythromycinMicrobiologyEscherichia coliAgarBiochemistryGeneBacteriaAntibioticsGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The Wzy-dependent capsular polysaccharide export system consists of an outer membrane channel (Wza), inner membrane channel and tyrosine autokinase (Wzc), and regulatory phosphatase (Wzb), and is responsible for the export and assembly of extracellular polysaccharide capsules. In Escherichia coli K30, this system is critical for the formation of group 1 capsules. Previous studies have shown that E. coli K30 Δwza and Δwza-wzb-wzc have greater resistance to erythromycin, a macrolide antibiotic, on solid media compared to wild-type K30; however, the opposite phenotype was observed in liquid media. Therefore, we hypothesized that the different erythromycin resistance phenotypes in E. coli K30 wild-type, Δwza, and Δwza-wzb-wzc are due to differences in biofilm production in solid and liquid media. In this study, we investigated whether biofilm formation is correlated with the differential erythromycin resistance phenotype of wild-type E. coli K30, Δwza, and Δwza-wzb-wzc in solid and liquid media. Erythromycin disc diffusion assays on solid media, minimum inhibitory concentration assays in liquid media and crystal violet biofilm assays were performed on all three strains. We found that Δwza and Δwza-wzb-wzc were more resistant than the wild-type strain on solid media, but all three strains had similar levels of resistance in liquid media. In contrast to previous studies, we obtained consistent erythromycin MIC values in liquid media and determined that it was between 125 and 250 μg/mL, but we were unable to obtain consistent biofilm formation among our three trials. Thus, we conclude that there is no correlation between biofilm production and erythromycin resistance in E. coli K30 wild-type, Δwza, and Δwza-wzb-wzc in liquid media.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,063
Score d'incertitude au seuil0,990

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,204
Écart entre enseignants0,195 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueOpen CollectionsMême sujetBacterial Genetics and BiotechnologyTravaux en français237 207