FABP7 Binds to Fatty Acid Micelles: Implications for Lipid Transport
Notice bibliographique
Résumé
Abstract The transport of hydrophobic molecules, including long-chain fatty acids, within cells is highly dynamic. Hydrophobic molecules are unable to freely diffuse through the aqueous cytoplasm without a transporter. Fatty acid binding proteins (FABP) transport these molecules to different cellular compartments. As part of their transport, FABPs often associate with cell membranes to acquire and deliver their bound cargo. Understanding the nature of this transport is becoming increasingly important because lipid signaling functions are associated with metabolic pathways impacting disease pathologies such as carcinomas, autism and schizophrenia. Herein, we focus on Brain fatty acid binding protein (FABP7), which demonstrates localization to the cytoplasm and nucleus, influencing transcription and fatty acid metabolism. We use a combined biophysical approach to elucidate the interaction between FABP7 and model membranes. Specifically, we use microscale thermophoresis to show that FABP7 can bind oleic acid (OA) and docosahexaenoic acid (DHA) micelles, while differential scanning fluorimetry experiments show binding lowers the melting temperature of FABP7. Structural data from NMR and multiscale molecular dynamics simulations reveals that the interaction between FABP7 and micelles is through FABP7’s portal region residues. Our simulations also capture binding events where fatty acids dissociate from the model membrane and bind to FABP7. Overall, our data reveals a novel interaction between FABP7 and OA or DHA micelles and provides key structural insight into the transport of hydrophobic molecules. Significance This study examines how FABP7 binds to fatty acids at low and high fatty acid concentrations. Our binding assays, including microscale thermophoresis (MST) and Nile red fluorescence establish that FABP7 binds to both free fatty acids in solution and fatty acid micelles. NMR and computational experiments show that FABP7 specifically interacts with micelles through the portal region of the protein, thereby mediating ligand transfer into the binding cavity.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».