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Enregistrement W3208649677 · doi:10.1101/2021.10.26.21265146

Detection of SARS-CoV-2 RNA Throughout Wastewater Treatment Plants and A Modeling Approach to Understand COVID-19 Infection Dynamics in Winnipeg, Canada

2021· preprint· en· W3208649677 sur OpenAlexafffundabout
Kadir Yanaç, Adeola Adegoke, Liqun Wang, Qiuyan Yuan, Miguel Uyaguari

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSARS-CoV-2 detection and testing
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésEffluentWastewaterSewage treatmentSevere acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)Ultrafiltration (renal)Coronavirus disease 2019 (COVID-19)Environmental scienceFlocculationSecondary treatmentBiologyPulp and paper industryChemistryEnvironmental engineeringChromatographyMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Although numerous studies have detected SARS-CoV-2 in wastewater and attempted to find correlations between the concentration of SARS-CoV-2 and the number of cases, no consensus has been reached on sample collection and processing, and data analysis. Moreover, the fate of SARS-CoV-2 in wastewater treatment plants is another issue, specifically regarding the discharge of the virus into environmental settings and the water cycle. The current study monitored SARS-CoV-2 in influent and effluent wastewater samples with three different concentration methods and sludge samples over six months (July to December 2020) to compare different virus concentration methods, assess the fate of SARS-CoV-2 in wastewater treatment plants, and describe the potential relationship between SARS-CoV-2 concentrations in influent and infection dynamics. Skimmed milk flocculation (SMF) resulted in higher recoveries (15.27% ± 3.32%) of an internal positive control, Armored RNA, and higher positivity rate of SARS-CoV-2 in samples compared to ultrafiltration methods employing a prefiltration step to eliminate solids. Our results suggested that SARS-CoV-2 may predominate in solids and therefore, concentration methods focusing on both supernatant and solid fractions may result in better recovery. SARS-CoV-2 was detected in influent and primary sludge samples but not in secondary and final effluent samples, indicating a significant reduction during primary and secondary treatments. SARS-CoV-2 was first detected in influent on September 30 th , 2020. A decay-rate formula was applied to estimate initial concentrations of late-processed samples with SMF. A model based on shedding rate and new cases was applied to estimate SARS-CoV-2 concentrations and the number of active shedders. Inferred sensitivity of observed and modeled concentrations to the fluctuations in new cases and test-positivity rates indicated a potential contribution of newly infected individuals to SARS-CoV-2 loads in wastewater.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,483
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,109
Tête enseignante GPT0,329
Écart entre enseignants0,220 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2021
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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