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Enregistrement W3208866695 · doi:10.5281/zenodo.19460155

neurostuff/NiMARE: 0.0.8

2021· article· en· W3208866695 sur OpenAlexaff
Taylor Salo, Tal Yarkoni, Thomas E. Nichols, Jean‐Baptiste Poline, James D. Kent, Krzysztof J. Gorgolewski, Enrico Glerean, Katherine L. Bottenhorn, Murat Bilgel, Jessey Wright, Puck C. Reeders, Adam Kimbler, Dylan N. Nielson, Julio A. Yanes, Alexandre Perez-Lebel, Kendra Oudyk, Dorota Jarecka

Notice bibliographique

RevueOpen MIND · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAdvanced Neuroimaging Techniques and Applications
Établissements canadiensMontreal Neurological Institute and HospitalMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésComputer science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Release Notes This release includes a number of bug-fixes, along with enhancements to how many tools within NiMARE implement low-memory options. In addition, we have renamed the CBMA estimators' null methods. The "analytic" method is now "approximate" and the "empirical" method is now "montecarlo". Changes [REF] Rename CBMA null distribution generation methods (#494) @tsalo [FIX] Add informative error when NeuroVault collection is not found (#500) @tsalo [ENH] Support symmetric GCLDA topics with more than two subregions (#499) @tsalo [DOC] Add sphinx-copybutton to docs requirements (#502) @tsalo [ENH] Incorporate information about valid masking approaches into IBMA Estimators (#495) @tsalo [FIX] Deal with extreme t-values in t_to_z by truncating associated p-values (#498) @tsalo [TST] Add flake8-isort to test dependencies (#493) @tsalo [REF] Miscellaneous GCLDA cleanup (#486) @tsalo [DOC] Add new functions and classes to API documentation (#490) @tsalo [ENH] add images_to_coordinates (#446) @jdkent [ENH] Add check_type function (#480) @tsalo [REF] Add low_memory option to Estimators and add function for moving metadata from Dataset to DataFrame (#476) @tsalo [FIX] Set Dataset.basepath using absolute path (#474) @tsalo [FIX] Find common stem in find_stem instead of largest common substring (#472) @tsalo [FIX] Replace misspelled "log_p" with "logp" (#468) @tsalo [FIX] Assume non-symmetric null distribution in ALESubtraction (#464) @tsalo [TST] Add memmap test. (#463) @jdkent [REF] Write temporary files to the NiMARE data directory (#460) @tsalo [REF] Use saved MA maps, when available, in CBMA estimators (#462) @tsalo [FIX] Neurovault name collisions (#457) @jdkent [FIX] Update niftimasker in dataset blob (#459) @jdkent [FIX] Add work-around for maskers that do not accept 1D input (#455) @jdkent [ENH] Add low-memory option for kernel transformers (#453) @tsalo [ENH] add function to convert neurovault collections to a NiMARE dataset (#432) @jdkent [FIX] Ensure IBMA results have the expected number of dimensions (#450) @jdkent [STY, TST] Add flake8-docstrings to requirements (#435) @tsalo

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,024
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Logiciel · Signal consensuel: Logiciel
Score de désaccord entre enseignants0,831
Score d'incertitude au seuil0,242

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,024
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,003
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,002
Bibliométrie0,0040,002
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0060,007
Science ouverte0,0060,008
Intégrité de la recherche0,0030,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,8310,812

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,191
Tête enseignante GPT0,441
Écart entre enseignants0,250 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreLogiciel

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission1
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