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Enregistrement W3208871179 · doi:10.5281/zenodo.3544468

nipy/nibabel: 3.0.0rc1

2019· article· en· W3208871179 sur OpenAlexaff
Matthew Brett, Christopher J. Markiewicz, Michael Hanke, Marc-Alexandre Côté, Ben Cipollini, Paul J. McCarthy, Christopher Cheng, Yaroslav O. Halchenko, Michiel Cottaar, Satrajit Ghosh, Eric B. Larson, Demián Wassermann, Stephan Gerhard, Gregory R. Lee, Hao-Ting Wang, Erik K. Kastman, Ariel Rokem, Cindee Madison, Félix C. Morency, Brendan Moloney, Mathias Goncalves, Cameron Riddell, Christopher Burns, Jarrod Millman, Alexandre Gramfort, Jaakko Leppäkangas, Ross D. Markello, Jasper J.F. van den Bosch, Robert D. Vincent, Henry Braun, Krish Subramaniam, Krzysztof J. Gorgolewski, Pradeep Reddy Raamana, B. Nolan Nichols, Eric M. Baker, Soichi Hayashi, Basile Pinsard, Christian Haselgrove, Mark Hymers, Oscar Estéban, Serge Koudoro, Nikolaas N. Oosterhof, Bago Amirbekian, Ian Nimmo‐Smith, Ly Nguyen, Samir Reddigari, Samuel St‐Jean, Egor Panfilov, Eleftherios Garyfallidis, Gaël Varoquaux, Jakub Kaczmarzyk, Jon Haitz Legarreta, Kevin S. Hahn, Oliver Hinds, Bennet Fauber, Jean‐Baptiste Poline, Jon Stutters, Kesshi Jordan, Matthew Cieslak, Miguel Estevan Moreno, Valentin Haenel, Yannick Schwartz, Bertrand Thirion, Dimitri Papadopoulos Orfanos, Fernando Pérez‐García, Igor Solovey, Iván González, Jath Palasubramaniam, Justin Lecher, Katrin Leinweber, Konstantinos Raktivan, Philippe Gervais, Syam Gadde, Thomas Ballinger, Thomas Roos, Venkateswara Reddy Reddam, freec

Notice bibliographique

RevueFigshare · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCell Image Analysis Techniques
Établissements canadiensMcGill UniversityMontreal Neurological Institute and HospitalUniversité de SherbrookeBaycrest HospitalUbisoft (Canada)
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésComputer science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Most work on NiBabel so far has been by Matthew Brett (MB), Chris Markiewicz (CM), Michael Hanke (MH), Marc-Alexandre Côté (MC), Ben Cipollini (BC), Paul McCarthy (PM), Chris Cheng (CC), Yaroslav Halchenko (YOH), Satra Ghosh (SG), Eric Larson (EL), Demian Wassermann, and Stephan Gerhard. References like "pr/298" refer to github pull request numbers. 3.0.0rc1 (Saturday 16 November 2019) Release candidate for NiBabel 3.0, initiating a minimum one-month testing window. Downstream projects are requested to test against the release candidate by installing with <code>pip install --pre nibabel</code>. New features ArrayProxy method <code>get_scaled()</code> scales data with a dtype of a specified precision, promoting as necessary to avoid overflow. This is to used in <code>img.get_fdata()</code> to control memory usage. (pr/833) (CM, reviewed by Ross Markello) GiftiImage method <code>agg_data()</code> to return usable data arrays (pr/793) (Hao-Ting Wang, reviewed by CM) Accept <code>os.PathLike</code> objects in place of filenames (pr/610) (Cameron Riddell, reviewed by MB, CM) Function to calculate obliquity of affines (pr/815) (Oscar Esteban, reviewed by MB) Enhancements <code>get_fdata(dtype=np.float32)</code> will attempt to avoid casting data to <code>np.float64</code> when scaling parameters would otherwise promote the data type unnecessarily. (pr/833) (CM, reviewed by Ross Markello) <code>ArraySequence</code> now supports a large set of Python operators to combine or update in-place. (pr/811) (MC, reviewed by Serge Koudoro, Philippe Poulin, CM, MB) Warn, rather than fail, on DICOMs with unreadable Siemens CSA tags (pr/818) (Henry Braun, reviewed by CM) Improve clarity of coordinate system tutorial (pr/823) (Egor Panfilov, reviewed by MB) Bug fixes Sliced <code>Tractogram</code>s no longer <code>apply_affine</code> to the original <code>Tractogram</code>'s streamlines. (pr/811) (MC, reviewed by Serge Koudoro, Philippe Poulin, CM, MB) Re-import externals/netcdf.py from scipy to resolve numpy deprecation (pr/821) (CM) Maintenance Support Python &gt;=3.5.1, including Python 3.8.0 (pr/787) (CM) Manage versioning with slightly customized Versioneer (pr/786) (CM) Reference Nipy Community Code and Nibabel Developer Guidelines in GitHub community documents (pr/778) (CM, reviewed by MB) API changes and deprecations Deprecate <code>ArraySequence.data</code> in favor of <code>ArraySequence.get_data()</code>, which will return a copy. <code>ArraySequence.data</code> now returns a read-only view. (pr/811) (MC, reviewed by Serge Koudoro, Philippe Poulin, CM, MB) Deprecate <code>DataobjImage.get_data()</code> API, to be removed in nibabel 5.0 (pr/794, pr/809) (CM, reviewed by MB)

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,639
Score d'incertitude au seuil0,996

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,1100,005

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,251
Écart entre enseignants0,242 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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